25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1186 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1186  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  451  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1622  hypothetical protein  44.23 
 
 		 227 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2107  hypothetical protein  40.72 
 
 		 234 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.717396 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1730  hypothetical protein  44.32 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.716461  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2526  hypothetical protein  39.91 
 
 		 236 aa  160  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.755196  normal  0.82322 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1758  hypothetical protein  40.29 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.162023  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2257  hypothetical protein  41.24 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2389  hypothetical protein  41.24 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942806 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2431  hypothetical protein  41.24 
 
 		 242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.344644  normal  0.298555 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1895  hypothetical protein  41.24 
 
 		 242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.731685  normal  0.571697 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1861  hypothetical protein  41.24 
 
 		 242 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.929031  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1888  hypothetical protein  41.24 
 
 		 242 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.169279  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2451  hypothetical protein  39.72 
 
 		 237 aa  152  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2584  hypothetical protein  41.75 
 
 		 237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2180  hypothetical protein  40.72 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.842277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1937  hypothetical protein  42.31 
 
 		 236 aa  138  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2191  hypothetical protein  40.31 
 
 		 233 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.604647  hitchhiker  0.000928347 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3749  hypothetical protein  27.8 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4217  hypothetical protein  24.79 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000127918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16922  predicted protein  26.62 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1655  hypothetical protein  29.94 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0155493  normal  0.785043 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04854  conserved hypothetical protein  36.45 
 
 		 269 aa  49.3  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1977  hypothetical protein  22.55 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153346  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6617  hypothetical protein  26.04 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00981466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5365  hypothetical protein  28.72 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>