22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0435 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0444  BFD-like iron-sulfur cluster-binding protein  100 
 
 		 57 aa  108  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0435  BFD-like iron-sulfur cluster-binding protein  100 
 
 		 57 aa  108  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2866  2Fe-2S-binding domain-containing protein  57.89 
 
 		 71 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0554434  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2551  2Fe-2S-binding domain-containing protein  57.89 
 
 		 71 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1808  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.540024  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0221  iron-sulfur cluster-binding protein  51.85 
 
 		 61 aa  51.6  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0220  iron-sulfur cluster-binding protein  50 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.297456  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1375  FAD dependent oxidoreductase  40.38 
 
 		 461 aa  47.8  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.575431  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0647  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  51.85 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000033306  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1669  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  51.67 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.856867  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0620  FAD dependent oxidoreductase  44 
 
 		 478 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1328  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  47.06 
 
 		 870 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0740855  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 479 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1617  hypothetical protein  41.51 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18680  hypothetical protein  41.51 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.349817 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0012  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  47.92 
 
 		 464 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0012  FAD-dependent oxidoreductase  47.92 
 
 		 464 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3284  molybdopterin oxidoreductase  47.5 
 
 		 804 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0283  FAD dependent oxidoreductase  38.46 
 
 		 475 aa  40.4  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1324  FAD dependent oxidoreductase  39.22 
 
 		 479 aa  40.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00260762  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  35.19 
 
 		 1228 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1552  FAD dependent oxidoreductase  38 
 
 		 494 aa  40  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.374477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>