19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2866 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2866  2Fe-2S-binding domain-containing protein  100 
 
 
71 aa  142  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0554434  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2551  2Fe-2S-binding domain-containing protein  100 
 
 
71 aa  142  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1808  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  51.56 
 
 
71 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.540024  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0444  BFD-like iron-sulfur cluster-binding protein  57.89 
 
 
57 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0435  BFD-like iron-sulfur cluster-binding protein  57.89 
 
 
57 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1375  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 
461 aa  48.9  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.575431  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0283  FAD dependent oxidoreductase  40.98 
 
 
475 aa  48.5  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0221  iron-sulfur cluster-binding protein  46.67 
 
 
61 aa  47.4  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0220  iron-sulfur cluster-binding protein  45 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.297456  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2168  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  55 
 
 
483 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586503  hitchhiker  0.00172973 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0012  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  47.92 
 
 
464 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0012  FAD-dependent oxidoreductase  47.92 
 
 
464 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0697  FAD dependent oxidoreductase  35 
 
 
480 aa  44.3  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0620  FAD dependent oxidoreductase  42 
 
 
478 aa  44.3  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1552  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 
494 aa  43.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.374477  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1324  FAD dependent oxidoreductase  37.25 
 
 
479 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00260762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1362  FAD dependent oxidoreductase  35.29 
 
 
479 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  36 
 
 
479 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3284  molybdopterin oxidoreductase  41.46 
 
 
804 aa  40.8  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>