41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0102 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0102  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000170522  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0105  hypothetical protein  41.38 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0101  hypothetical protein  37.36 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000075579  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0315  hypothetical protein  27.61 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.428114  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0309  hypothetical protein  26.87 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5526  group-specific protein  32.76 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173284  hitchhiker  0.0000000104917 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3823  hypothetical protein  37.23 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4985  hypothetical protein  38.67 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0146407  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5424  group-specific protein  31.9 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00185358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5394  hypothetical protein  38.67 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.58278e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5153  hypothetical protein  38.67 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000141896  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5480  hypothetical protein  30.83 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5003  group-specific protein  38.67 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000242715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5545  hypothetical protein  38.67 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000433429  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5428  hypothetical protein  30 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.210935  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2194  protein of unknown function DUF975  39.47 
 
 		 216 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1763  integral membrane protein  45.95 
 
 		 200 aa  54.7  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00234926  normal  0.0438415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5101  hypothetical protein  48 
 
 		 261 aa  53.9  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1989  hypothetical protein  55.56 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193754  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5427  hypothetical protein  41.94 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.176134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5527  integral membrane protein  41.94 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000108543  hitchhiker  0.0000000242358 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4984  hypothetical protein  41.94 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0797538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3044  hypothetical protein  39.39 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000181685  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5544  hypothetical protein  41.94 
 
 		 217 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000271519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5393  hypothetical protein  41.94 
 
 		 217 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.62077e-32 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5152  hypothetical protein  41.94 
 
 		 217 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000285957  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5002  hypothetical protein  41.94 
 
 		 217 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000139015  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5423  integral membrane protein  40.32 
 
 		 214 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00180581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5100  hypothetical protein  40.32 
 
 		 217 aa  49.3  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2008  hypothetical protein  50 
 
 		 252 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000169588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5609  hypothetical protein  54.55 
 
 		 252 aa  48.9  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0213  hypothetical protein  28.57 
 
 		 257 aa  48.9  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4213  integral membrane protein  38.71 
 
 		 217 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.395001 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3114  hypothetical protein  33.98 
 
 		 252 aa  46.6  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.692009  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0026  integral membrane protein  44 
 
 		 247 aa  46.2  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.667689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23050  predicted integral membrane protein  38.6 
 
 		 315 aa  46.2  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0978  hypothetical protein  37.1 
 
 		 217 aa  45.8  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2658  hypothetical protein  50 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2675  hypothetical protein  50 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159385 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2476  hypothetical protein  50 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.058907  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0528  integral membrane protein  46.34 
 
 		 244 aa  43.5  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>