29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN02000 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006683  CNN02000    100 
 
 
5844 bp  11590    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01510    92.36 
 
 
1392 bp  1871    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.83208  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01480    96.43 
 
 
12126 bp  821    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.363818  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03140  retrotransposon nucleocapsid protein, putative  99.4 
 
 
4787 bp  6740    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03040    98.3 
 
 
6606 bp  5223    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02990    97.43 
 
 
4911 bp  874    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000623592  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02940    97.52 
 
 
6219 bp  7240    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.339763  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02920    98.69 
 
 
11331 bp  7598    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.355289  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03610    97.36 
 
 
3504 bp  2676    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.370097  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00570    97.76 
 
 
585 bp  644    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.112431  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00550    97.14 
 
 
1743 bp  821    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00510    97 
 
 
3126 bp  785    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0721861  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03620    95.31 
 
 
1755 bp  767    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124458  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03690    98.15 
 
 
7809 bp  3973    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.858163  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03700    95.07 
 
 
3273 bp  2553    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389687  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02780    96.16 
 
 
7383 bp  714    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0276994  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02790    97.22 
 
 
11454 bp  870    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02840    98.26 
 
 
6225 bp  7464    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00510    96.82 
 
 
5559 bp  737    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748048  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00530    96.16 
 
 
4734 bp  714    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0903388  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03050    96.62 
 
 
2400 bp  630  1e-177  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02950    95.71 
 
 
5775 bp  436  1e-119  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0398404  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01450    94.18 
 
 
3186 bp  420  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03120    89.69 
 
 
2895 bp  315  8e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03030    89.42 
 
 
7155 bp  311  1.0000000000000001e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.566664  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00520    93.1 
 
 
4542 bp  268  2e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285744  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03650    96.8 
 
 
4674 bp  208  9.999999999999999e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02050    96.04 
 
 
3573 bp  168  1e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.250754  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01490    100 
 
 
12648 bp  50.1  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
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