31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK00010 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006680  CNK00010  hypothetical protein  100 
 
 
1047 aa  2087    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  40 
 
 
334 aa  79.7  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  38.46 
 
 
331 aa  65.1  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  40.34 
 
 
333 aa  64.3  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  40.83 
 
 
330 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  40.34 
 
 
333 aa  64.3  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1444  hypothetical protein  43.43 
 
 
857 aa  61.2  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  43.52 
 
 
332 aa  59.3  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1973  hypothetical protein  37.74 
 
 
303 aa  58.5  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000663025  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  39.02 
 
 
925 aa  55.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31752  predicted protein  54.17 
 
 
1048 aa  54.3  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0703442 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2154  excalibur domain family  38.89 
 
 
287 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1940  Cold-shock protein DNA-binding protein  37.18 
 
 
290 aa  52.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.376241  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2180  hypothetical protein  37.39 
 
 
318 aa  52.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44924  predicted protein  25 
 
 
743 aa  50.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0911  hypothetical protein  29.47 
 
 
263 aa  49.3  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0149875  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49716  predicted protein  35.92 
 
 
598 aa  48.5  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.732507  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1952  hypothetical protein  38.6 
 
 
287 aa  48.5  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  50 
 
 
990 aa  48.5  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  50 
 
 
959 aa  48.5  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  48.65 
 
 
964 aa  47.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02530  hypothetical protein  31.41 
 
 
1353 aa  47  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03668  PHD finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12400)  33.12 
 
 
827 aa  46.6  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0219111  normal  0.0876759 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49618  predicted protein  29.59 
 
 
958 aa  46.2  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45987  predicted protein  27.12 
 
 
2344 aa  46.2  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.54 
 
 
561 aa  46.2  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43680  predicted protein  34.91 
 
 
1458 aa  45.8  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.16765  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1331  hypothetical protein  24.46 
 
 
247 aa  45.1  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1897  TolA protein, membrane component  26.15 
 
 
335 aa  45.1  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2419  Heat shock protein 70  28.72 
 
 
640 aa  44.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00490  Pol II transcription elongation factor, putative  37.82 
 
 
1186 aa  44.7  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.84309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>