12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE03900 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006687  CNE03900  expressed protein  100 
 
 
439 aa  876    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  33.33 
 
 
279 aa  54.7  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  29.37 
 
 
220 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  30.77 
 
 
261 aa  49.7  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  27.27 
 
 
169 aa  49.3  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  28.19 
 
 
301 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  24.37 
 
 
611 aa  47  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  25.9 
 
 
187 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1174  beta-Ig-H3/fasciclin  30.16 
 
 
184 aa  45.1  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  26.95 
 
 
202 aa  45.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  25.18 
 
 
187 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  23.44 
 
 
558 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>