15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC01280 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC01280  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 562 aa  1161    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04458  snRNP assembly factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07520)  45.7 
 
 		 616 aa  428  1e-118  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.472172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28684  predicted protein  35.12 
 
 		 474 aa  299  1e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61453  ubiquitin specific protease  35.27 
 
 		 489 aa  285  2.0000000000000002e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.981787  normal  0.483859 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2491  predicted protein  38.02 
 
 		 423 aa  283  8.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000443928  normal  0.292142 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2936  predicted protein  24 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07360  ubiquitin-specific protease, putative  22.67 
 
 		 1312 aa  67  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_3692  predicted protein  22.64 
 
 		 347 aa  51.2  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03680  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, putative  23.9 
 
 		 1490 aa  48.5  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.920906  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_69820  predicted protein  29.51 
 
 		 1340 aa  47.4  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39993  predicted protein  31.08 
 
 		 688 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000426118  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3954  predicted protein  20.5 
 
 		 344 aa  46.2  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62413  predicted protein  22.95 
 
 		 848 aa  45.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.776839  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03711  ubiquitin C-terminal hydrolase Ubp8, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12710)  24.65 
 
 		 484 aa  44.3  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.954307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87099  predicted protein  22.53 
 
 		 830 aa  43.9  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000037034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>