20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB01560 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB01560  tubulin binding protein, putative  100 
 
 		 2072 aa  4061    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.492475  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07757  Anucleate primary sterigmata protein A [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00083]  35.76 
 
 		 1676 aa  196  4e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832229  normal  0.432152 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05829  nuclear migration protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07730)  33.57 
 
 		 1275 aa  89.4  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  24.89 
 
 		 1240 aa  87  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1702  articulin, putative  50 
 
 		 312 aa  71.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.71393  normal  0.132681 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0237  OmpA/MotB domain protein  60.42 
 
 		 491 aa  59.3  0.0000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1825  hypothetical protein  71.43 
 
 		 210 aa  55.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00129958  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30179  hypothetical protein  44.04 
 
 		 617 aa  50.4  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0761319 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2343  chromosome segregation ATPases-like  24.14 
 
 		 684 aa  49.3  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.381271  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.96 
 
 		 637 aa  47.8  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.96 
 
 		 637 aa  47.8  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  28.96 
 
 		 637 aa  47.8  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.96 
 
 		 637 aa  47.8  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.96 
 
 		 637 aa  47.8  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.96 
 
 		 637 aa  47.8  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.96 
 
 		 637 aa  47.8  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  28.96 
 
 		 637 aa  47.8  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  28.96 
 
 		 637 aa  47.8  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1852  chromosome segregation ATPase-like protein  30.59 
 
 		 380 aa  47  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.518823  normal  0.814209 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2252  TPR repeat-containing protein  37.2 
 
 		 1022 aa  46.6  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0647167  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>