71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0448 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0448  cvpA family protein  100 
 
 		 187 aa  363  1e-100  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.179388  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0422  cvpA family protein  98.4 
 
 		 187 aa  358  2e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00865734  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1558  cvpA family protein  97.84 
 
 		 190 aa  352  1e-96  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0486  conserved hypothetical integral membrane protein, CvpA family  58.82 
 
 		 189 aa  226  1e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1144  CvpA family protein  44.5 
 
 		 191 aa  156  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.111431  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0223  CvpA family protein  45.09 
 
 		 206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.903437  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1644  CvpA family protein  42.02 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0999  CvpA family protein  45 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000386189  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0578  Colicin V production protein  42.78 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.637194  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1271  colicin V production protein  41.82 
 
 		 216 aa  95.9  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2162  colicin V production protein  28.4 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.340208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1872  colicin V production protein  28.21 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.356571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3077  Colicin V production protein  28.66 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.770622 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2461  colicin V production protein  29.41 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400499  normal  0.228634 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4403  colicin V production protein  34.58 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.454399  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3964  colicin V production protein  34.58 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3564  colicin V production protein  34.58 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4616  colicin V production protein  28.66 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  30.89 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2454  colicin V production family protein  31.06 
 
 		 155 aa  52  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0161  colicin V production protein  29.91 
 
 		 162 aa  51.6  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.781375  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2119  colicin V production protein  32.71 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.73318  normal  0.0950051 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1079  colicin V production protein (protein DedE)  26.99 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2681  CvpA family protein  29.05 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  32.54 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0192  cvpA family protein  28.04 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_180  integral membrane colicin V production protein  29.03 
 
 		 162 aa  49.3  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00284357  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3051  colicin V production protein  25.93 
 
 		 163 aa  49.3  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00964388  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3859  colicin V production protein  33.64 
 
 		 164 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3354  colicin V production protein  33.64 
 
 		 164 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0307  CvpA family protein  25.27 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.617948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4049  colicin V production protein  29.87 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.868969  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03096  hypothetical protein  30 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2073  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  28.03 
 
 		 168 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0393  colicin V production protein  32.04 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002878  colicin V production protein  30 
 
 		 163 aa  45.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0771  colicin V production protein  25.99 
 
 		 182 aa  45.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0780  colicin V production protein  26.28 
 
 		 173 aa  45.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  27.5 
 
 		 164 aa  44.7  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0356  Colicin V production protein  30.69 
 
 		 169 aa  44.7  0.0009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0696  colicin V production protein  27.03 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.518135  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4408  Colicin V production protein  28.31 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2490  CvpA family protein  29.91 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.904842  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1044  Colicin V production protein  33.61 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4380  colicin V production protein  30.84 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1015  Colicin V production protein  25 
 
 		 161 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1723  Colicin V production protein  25.45 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.558498  normal  0.0591031 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2065  CvpA family protein  25.45 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2401  colicin V production protein  24.12 
 
 		 234 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0524  bacteriocin production protein  30.17 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00361211  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2194  Colicin V production protein  23.03 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  25.95 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.530952 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2300  colicin V production protein  28.8 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113958  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4301  Colicin V production protein  27.71 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.678611  normal  0.0583187 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3091  CvpA family protein  28.44 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0487  CvpA protein  24.71 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.457709  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1102  colicin V production protein  31.9 
 
 		 165 aa  42.4  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.374563 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3933  colicin V production protein  27.71 
 
 		 197 aa  42  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.838461  normal  0.0661094 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1907  colicin V production protein  30.19 
 
 		 174 aa  42.4  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1608  colicin V production protein  30.65 
 
 		 162 aa  41.6  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0129  membrane protein CvpA, putative  24.28 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.058893  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2301  CvpA family protein  32.08 
 
 		 164 aa  41.2  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0763  CvpA family protein  32.08 
 
 		 164 aa  41.2  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0535  CvpA family protein  32.08 
 
 		 164 aa  41.2  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2439  CvpA family protein  32.08 
 
 		 164 aa  41.2  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267781  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1864  CvpA family protein  32.08 
 
 		 164 aa  41.2  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1655  CvpA family protein  32.08 
 
 		 164 aa  41.2  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.984666  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1266  colicin V production protein  29.36 
 
 		 198 aa  41.2  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.488094  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1715  CvpA family protein  32.08 
 
 		 164 aa  41.2  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0777  colicin V production protein  32.71 
 
 		 188 aa  41.2  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136777  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2879  Colicin V production protein  23.87 
 
 		 182 aa  40.8  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.999004  normal  0.111961 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>