16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3531 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3531  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  296  6e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.325005 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3916  hypothetical protein  46.85 
 
 
153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00240375  hitchhiker  0.00943034 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1409  hypothetical protein  38.36 
 
 
150 aa  94.7  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.523935  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0893  hypothetical protein  37.14 
 
 
147 aa  90.1  8e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4930  hypothetical protein  35.66 
 
 
148 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.325685  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0895  hypothetical protein  33.08 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1928  hypothetical protein  24.67 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.344998  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6738  hypothetical protein  31.76 
 
 
152 aa  51.2  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.396339 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2911  hypothetical protein  27.87 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.215137 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0399  hypothetical protein  25.22 
 
 
154 aa  47.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1108  hypothetical protein  32.93 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.843935  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6957  hypothetical protein  25.98 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329306  normal  0.232269 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2903  hypothetical protein  27 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.851598  normal  0.0646646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2438  hypothetical protein  25.19 
 
 
155 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.84671  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0915  hypothetical protein  27.47 
 
 
207 aa  41.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.275213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0491  hypothetical protein  31.82 
 
 
172 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>