207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3461 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3461  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  648    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0172229 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4414  protein of unknown function DUF403  29.43 
 
 		 334 aa  134  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0732  protein of unknown function DUF403  28.31 
 
 		 355 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1750  protein of unknown function DUF403  31.5 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.594588  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1064  protein of unknown function DUF403  27.64 
 
 		 354 aa  133  5e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1492  protein of unknown function DUF403  28.03 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0309521  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1184  hypothetical protein  28.66 
 
 		 357 aa  127  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.965632  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0396  protein of unknown function DUF403  30.61 
 
 		 320 aa  125  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.995526 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1743  hypothetical protein  26.85 
 
 		 356 aa  125  8.000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.331715  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1214  protein of unknown function DUF403  28.68 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2667  hypothetical protein  28.26 
 
 		 324 aa  123  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0164697  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3508  hypothetical protein  28.7 
 
 		 324 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3580  hypothetical protein  28.7 
 
 		 324 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0537512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3520  hypothetical protein  28.7 
 
 		 324 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.228526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2060  hypothetical protein  24.3 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.352485  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2637  hypothetical protein  27.07 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37252  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2265  hypothetical protein  27.82 
 
 		 327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1870  hypothetical protein  24.3 
 
 		 319 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.088676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3910  hypothetical protein  27.78 
 
 		 324 aa  119  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3066  hypothetical protein  25 
 
 		 316 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.417228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4767  protein of unknown function DUF403  27.08 
 
 		 329 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3107  hypothetical protein  24.69 
 
 		 316 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2798  protein of unknown function DUF403  29.69 
 
 		 327 aa  119  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119943  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2596  hypothetical protein  25.31 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0574332  normal  0.403817 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3182  protein of unknown function DUF403  28.25 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1736  hypothetical protein  25.31 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3012  hypothetical protein  23.77 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.256372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37680  hypothetical protein  24.38 
 
 		 316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.454306  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4494  protein of unknown function DUF403  27.43 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4430  protein of unknown function DUF403  27.43 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2132  hypothetical protein  31.25 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0017695  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2687  hypothetical protein  24.69 
 
 		 316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0355776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1033  hypothetical protein  28.29 
 
 		 318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.403724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3275  hypothetical protein  28.87 
 
 		 324 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000743183  normal  0.197732 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2416  hypothetical protein  24.76 
 
 		 316 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1079  hypothetical protein  24.76 
 
 		 316 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3875  protein of unknown function DUF403  25.71 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1402  hypothetical protein  26.71 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.236553 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1883  protein of unknown function DUF403  31.54 
 
 		 308 aa  113  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00213404 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0732  hypothetical protein  29.25 
 
 		 324 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.109994  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3760  hypothetical protein  25.71 
 
 		 319 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.198455  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3402  protein of unknown function DUF403  26.17 
 
 		 318 aa  112  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.454494  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4572  protein of unknown function DUF403  25.98 
 
 		 324 aa  112  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1013  protein of unknown function DUF403  27.68 
 
 		 312 aa  112  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0471288  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15701  hypothetical protein  28.62 
 
 		 324 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.743902  normal  0.307472 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1566  hypothetical protein  24.13 
 
 		 316 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.281936  normal  0.177657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2099  hypothetical protein  31.03 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5078  hypothetical protein  25.62 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605764 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3156  hypothetical protein  26.42 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.144051  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12438  hypothetical protein  28.63 
 
 		 325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.660926 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17360  hypothetical protein  28.04 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0522809  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5582  protein of unknown function DUF403  28.96 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487116  normal  0.888665 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3575  protein of unknown function DUF403  27.44 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.624833  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0936  protein of unknown function DUF403  24.85 
 
 		 322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1021  hypothetical protein  24.85 
 
 		 322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.434907  normal  0.790482 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3593  protein of unknown function DUF403  27.69 
 
 		 324 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0363  hypothetical protein  27.44 
 
 		 309 aa  109  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4444  protein of unknown function DUF403  25.16 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3319  hypothetical protein  26.65 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.846078  normal  0.720686 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2197  hypothetical protein  25.78 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.507276  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0764  hypothetical protein  25.16 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0539  hypothetical protein  26.81 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11431  hypothetical protein  28.25 
 
 		 313 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11441  hypothetical protein  28.25 
 
 		 313 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4512  hypothetical protein  25.71 
 
 		 316 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3414  hypothetical protein  26.85 
 
 		 314 aa  106  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1048  hypothetical protein  26.35 
 
 		 317 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0181882  normal  0.326786 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0392  hypothetical protein  24.76 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2049  protein of unknown function DUF403  27.99 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.715011 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1207  hypothetical protein  26.73 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2204  protein of unknown function DUF403  29.13 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.878183  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2057  hypothetical protein  28.24 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.647616  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1050  hypothetical protein  27.36 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3020  hypothetical protein  26.42 
 
 		 315 aa  103  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00142607  normal  0.658817 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0405  hypothetical protein  23.99 
 
 		 319 aa  102  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1084  hypothetical protein  24.76 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3389  hypothetical protein  26.75 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0824  hypothetical protein  24.29 
 
 		 319 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5274  hypothetical protein  24.76 
 
 		 314 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165267 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2255  protein of unknown function DUF403  28.96 
 
 		 317 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000569022 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1311  protein of unknown function DUF403  26.88 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.754495  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3034  hypothetical protein  26.36 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1941  hypothetical protein  23.03 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572678 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0965  protein of unknown function DUF403  24.92 
 
 		 316 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0328086 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1061  protein of unknown function DUF403  24.92 
 
 		 316 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.823298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1675  protein of unknown function DUF403  25.38 
 
 		 315 aa  100  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1122  hypothetical protein  25.95 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.225451  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1354  hypothetical protein  25.46 
 
 		 324 aa  98.2  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.531652  hitchhiker  0.00962099 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1814  hypothetical protein  25.71 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0331912  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2473  hypothetical protein  25.23 
 
 		 319 aa  97.4  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.353765  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2549  hypothetical protein  24.77 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0459959  normal  0.464961 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0070  hypothetical protein  23.27 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0505568  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3158  hypothetical protein  23.42 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.188108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0583  hypothetical protein  27.35 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2606  hypothetical protein  23.77 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0774  hypothetical protein  25.29 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2906  hypothetical protein  27.31 
 
 		 328 aa  92.8  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0307  hypothetical protein  26.25 
 
 		 310 aa  92.8  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.435724  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2523  protein of unknown function DUF403  27.31 
 
 		 328 aa  92.8  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42150  hypothetical protein  23.38 
 
 		 317 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>