54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1581 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1581  glycogen synthase, glycosyltransferase family 3 protein  100 
 
 
604 aa  1271    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0619337  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5697  Glycogen(starch) synthase  60.44 
 
 
606 aa  774    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3735  Glycogen (starch) synthase  60.07 
 
 
604 aa  758    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.860093 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08010  glycogen synthase (Eurofung)  45.88 
 
 
711 aa  528  1e-148  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.53633  normal  0.197205 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00590  glycogen (starch) synthase, putative  44.3 
 
 
733 aa  513  1e-144  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81231  glycogen (starch) synthase  42.67 
 
 
699 aa  502  1e-141  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.490915  normal  0.0297098 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0468  alpha-glucan phosphorylase  29.54 
 
 
1421 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.06142  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1285  alpha-glucan phosphorylase  28.43 
 
 
1413 aa  238  2e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1042  glycogen synthase, putative  28.74 
 
 
548 aa  231  2e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0023004 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0296  hypothetical protein  22.57 
 
 
603 aa  94.7  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1552  glycogen synthase  21.54 
 
 
594 aa  80.5  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.575386  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0433  hypothetical protein  28.89 
 
 
601 aa  55.5  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.430655  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4226  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
370 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 
446 aa  50.8  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 
396 aa  50.8  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 
408 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  35.9 
 
 
402 aa  50.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24.17 
 
 
419 aa  49.3  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 
410 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  35.9 
 
 
406 aa  49.3  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
422 aa  47.8  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  31.07 
 
 
423 aa  47.8  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  47.73 
 
 
400 aa  47.4  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
395 aa  47.4  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 
440 aa  47  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  29.41 
 
 
442 aa  47  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  35.94 
 
 
424 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0313  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
398 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  46.34 
 
 
353 aa  45.8  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
382 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  36 
 
 
391 aa  45.4  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  40.91 
 
 
381 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  42.55 
 
 
397 aa  45.4  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
381 aa  45.4  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  44.68 
 
 
351 aa  45.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 
417 aa  45.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  53.85 
 
 
384 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  36 
 
 
398 aa  45.1  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  36 
 
 
391 aa  45.1  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 
377 aa  44.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
415 aa  44.7  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 
536 aa  44.7  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  48.57 
 
 
391 aa  44.3  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  36.73 
 
 
390 aa  44.3  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1720  glycosyl transferase, group 1  23.98 
 
 
377 aa  44.3  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.588865 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  25.22 
 
 
405 aa  44.3  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
393 aa  44.3  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
420 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1253  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
351 aa  44.3  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708089  normal  0.587919 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  32.31 
 
 
410 aa  44.3  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1471  glycosyl transferase group 1  48.72 
 
 
383 aa  43.9  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.630233  normal  0.0889822 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  41.46 
 
 
410 aa  43.9  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 
457 aa  43.9  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
378 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>