More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0094 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0094  50S ribosomal protein L14  100 
 
 
122 aa  244  4e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.840193  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1865  50S ribosomal protein L14  89.34 
 
 
122 aa  224  2e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2071  50S ribosomal protein L14  89.34 
 
 
122 aa  224  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0845343  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0069  50S ribosomal protein L14  89.34 
 
 
122 aa  225  2e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0106985  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1023  50S ribosomal protein L14  89.34 
 
 
122 aa  224  2e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000448191  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1694  50S ribosomal protein L14  89.34 
 
 
122 aa  224  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00501261  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1767  50S ribosomal protein L14  90.16 
 
 
122 aa  224  3e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000168907  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0044  50S ribosomal protein L14  89.34 
 
 
122 aa  223  6e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.28524  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1958  ribosomal protein L14  85.25 
 
 
122 aa  216  7e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.709109  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0296  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  179  8.000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00255818  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  174  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1186  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  174  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.367223  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1223  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  174  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1966  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  174  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00306344  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0996  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  172  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0292243 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1356  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0481946  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1668  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  171  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0136083  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1850  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  171  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0690  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.114606  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1440  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4594  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1342  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0385141  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0708  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  170  5e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000253605  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0676  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  170  5e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000448087  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0729  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  170  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0102983  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5060  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  170  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.750337 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2746  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  169  7.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.014298  normal  0.185382 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01270  ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  169  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.630309  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1076  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  169  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00057031  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0943  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  169  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00200525  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1374  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  169  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.439933  normal  0.532331 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0383  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  169  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337556  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3657  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3438  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1555  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  169  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3318  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  169  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000362831 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0857  50S ribosomal protein L14P  66.39 
 
 
122 aa  169  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000045914  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0391  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  169  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0304428  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2829  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  168  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000599827  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0636  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  168  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143899  hitchhiker  0.0000000109372 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2247  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  168  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2305  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0162624  normal  0.103415 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3174  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.992271  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2315  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  168  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00156512  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2208  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  168  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.905763  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2191  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  168  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0711  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  168  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121544  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3634  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  168  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000265489  decreased coverage  0.00000000000145163 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0324  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  168  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000708463  decreased coverage  0.00245917 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0766  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  167  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115755  normal  0.0767388 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20770  LSU ribosomal protein L14P  67.21 
 
 
122 aa  167  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0485  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  167  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000117206  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0343  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  167  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867842  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0432  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  167  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000188868  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0847  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  167  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.226508  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1332  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  167  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000712057  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0330  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  167  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.0000000152451  hitchhiker  0.00105962 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1934  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000033095  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3159  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000901692  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2622  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328806  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3488  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00137445  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3794  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  167  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3766  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  167  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000108255  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3133  ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  167  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3058  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  167  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000279075  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3736  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  167  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000183624  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1157  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  167  5e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000242417  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0611  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  167  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00801409  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2362  ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  167  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.956656  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0698  ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  167  6e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0089  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  167  6e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890299 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5037  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  167  7e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000278288  normal  0.502921 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0852  ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  166  7e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0259  ribosomal protein L14  67.21 
 
 
162 aa  166  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00518224  hitchhiker  0.00445283 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09900  LSU ribosomal protein L14P  64.75 
 
 
122 aa  167  7e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0142429  hitchhiker  0.00000177092 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3009  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  166  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000263087  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2940  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  166  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000158675  hitchhiker  0.00000386502 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3287  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  166  8e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.00000000157529  decreased coverage  0.000000579661 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0295  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  166  9e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.830026 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3985  ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  166  9e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0504  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  166  9e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0466171  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2897  ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  166  9e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2764  ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  166  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000816669  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3713  ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  166  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.73396  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0235  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  166  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1364  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  166  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279063  normal  0.0203367 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0296  ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  166  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000987094  normal  0.0625902 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0443  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  166  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00471045  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4739  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0254345  normal  0.940147 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0969  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  166  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000461836  hitchhiker  0.00000100945 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04511  50S ribosomal protein L14  69.42 
 
 
119 aa  166  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00805091  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0264  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  166  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188398  normal  0.453731 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3421  ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  165  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0570  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  166  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08950  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.459474  normal  0.0351235 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0337  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  165  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15874  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0464  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825158  hitchhiker  0.0000027231 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4538  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  165  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.118021 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0187  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  165  2e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.396504 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1755  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  165  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.487668  normal  0.39775 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>