40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0331 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0331  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  578  1e-164  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.464299  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0860  hypothetical protein  44.96 
 
 
293 aa  222  6e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.110107  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0215  protein of unknown function DUF125 transmembrane  41.37 
 
 
300 aa  219  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0912  protein of unknown function DUF125 transmembrane  40.94 
 
 
291 aa  219  3.9999999999999997e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1653  hypothetical protein  41.26 
 
 
291 aa  218  8.999999999999998e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.850435  normal  0.0303841 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1572  protein of unknown function DUF125 transmembrane  40.7 
 
 
291 aa  217  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.493606  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0438  hypothetical protein  39.35 
 
 
284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0423  hypothetical protein  39.35 
 
 
284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1514  hypothetical protein  41.49 
 
 
292 aa  212  5.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671391  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1272  hypothetical protein  38.04 
 
 
291 aa  211  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1196  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.79 
 
 
285 aa  207  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1809  hypothetical protein  37.72 
 
 
288 aa  202  5e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.305818  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1173  protein of unknown function DUF125 transmembrane  39.65 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01890  uncharacterized membrane protein  41.55 
 
 
297 aa  198  7.999999999999999e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0801  protein of unknown function DUF125 transmembrane  37.32 
 
 
291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1189  hypothetical protein  36.96 
 
 
291 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1685  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.75 
 
 
289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1070  hypothetical protein  36.76 
 
 
292 aa  192  5e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1049  hypothetical protein  35.62 
 
 
293 aa  181  2e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2800  protein of unknown function DUF125 transmembrane  37.28 
 
 
292 aa  168  9e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.792813  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0704  hypothetical protein  30.69 
 
 
299 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.258152  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1650  hypothetical protein  34.75 
 
 
290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.381623  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0496  hypothetical protein  33.04 
 
 
299 aa  125  6e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1758  hypothetical protein  28.92 
 
 
297 aa  125  8.000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0216697  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0774  hypothetical protein  27.15 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.443952 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0378  protein of unknown function DUF125 transmembrane  32.67 
 
 
352 aa  93.6  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0516728  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0379  hypothetical protein  25.28 
 
 
362 aa  80.1  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1094  hypothetical protein  27.81 
 
 
374 aa  79.3  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0835  protein of unknown function DUF125 transmembrane  25.42 
 
 
358 aa  77.4  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1468  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.79 
 
 
361 aa  75.9  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181021  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0522  hypothetical protein  24.5 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.655797  normal  0.060241 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1618  hypothetical protein  24.38 
 
 
376 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524945  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0752  hypothetical protein  25.73 
 
 
371 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.575838  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0710  hypothetical protein  24.15 
 
 
372 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.441987  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0746  protein of unknown function DUF125 transmembrane  23.67 
 
 
372 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0747  protein of unknown function DUF125 transmembrane  23.67 
 
 
372 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0141065  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04290  uncharacterized membrane protein  27.51 
 
 
376 aa  51.6  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5039  protein of unknown function DUF125 transmembrane  23.38 
 
 
376 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.144378 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  26.4 
 
 
360 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5265  hypothetical protein  23.9 
 
 
374 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716255  normal  0.0847369 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>