47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0214 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0214  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  315  1e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1476  putative lipoprotein  68.55 
 
 
164 aa  228  2e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0087  hypothetical protein  38.79 
 
 
140 aa  84.3  7e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1507  hypothetical protein  33.33 
 
 
122 aa  61.6  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0689  transcriptional regulator  34.48 
 
 
297 aa  57.4  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  27.13 
 
 
232 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  27.13 
 
 
242 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  27.13 
 
 
232 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  27.13 
 
 
242 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  27.13 
 
 
232 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  27.13 
 
 
242 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  31.9 
 
 
234 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.9 
 
 
234 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6949  ThiJ/PfpI family protein  28.26 
 
 
238 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0470534  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1577  ThiJ/PfpI  31.62 
 
 
209 aa  54.3  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.25 
 
 
228 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  27.13 
 
 
691 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  30.47 
 
 
228 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  27.34 
 
 
238 aa  51.2  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  29.23 
 
 
224 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  30.83 
 
 
225 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1474  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.86 
 
 
232 aa  48.9  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.23 
 
 
224 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  28.68 
 
 
228 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  28.68 
 
 
228 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.93 
 
 
242 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  27.13 
 
 
220 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.19 
 
 
227 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  26.19 
 
 
227 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.19 
 
 
227 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2700  ThiJ/PfpI domain protein  29.1 
 
 
229 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  29.91 
 
 
212 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2887  ThiJ/PfpI  28.46 
 
 
233 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00139108  normal  0.0511878 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3031  ThiJ/PfpI  27.14 
 
 
234 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140928  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.24 
 
 
225 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  29.91 
 
 
226 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2879  ThiJ/PfpI  34.12 
 
 
201 aa  42.4  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3686  ThiJ/PfpI domain-containing protein  22.14 
 
 
239 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  26.15 
 
 
243 aa  42  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0492  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.87 
 
 
231 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  22.29 
 
 
199 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.17 
 
 
230 aa  41.2  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0965747 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.32 
 
 
193 aa  40.8  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  22.14 
 
 
234 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  22.14 
 
 
234 aa  40.4  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  21.76 
 
 
198 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  21.33 
 
 
199 aa  40.4  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>