31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0132 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0132  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  250  5.000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1084  hypothetical protein  52.63 
 
 
116 aa  121  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00346286  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0260  hypothetical protein  48.28 
 
 
115 aa  117  7e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1018  hypothetical protein  31.63 
 
 
117 aa  63.5  0.0000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05694  hypothetical protein  31.73 
 
 
128 aa  54.3  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000081  hypothetical protein  31.73 
 
 
129 aa  53.9  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.281171  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0303  hypothetical protein  30.77 
 
 
130 aa  52.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02270  hypothetical protein  30.1 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2307  hypothetical protein  33 
 
 
139 aa  52  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.58575e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0219  hypothetical protein  34.69 
 
 
101 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0218  hypothetical protein  34.69 
 
 
101 aa  50.4  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0324  hypothetical protein  28.85 
 
 
133 aa  48.9  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0293  hypothetical protein  29.09 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000641316  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0295  hypothetical protein  28.85 
 
 
133 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3649  hypothetical protein  28.85 
 
 
133 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.01691  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0395  hypothetical protein  27.88 
 
 
127 aa  47  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0404  hypothetical protein  27.88 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.455973  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4199  hypothetical protein  28.85 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4042  hypothetical protein  28.85 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4067  hypothetical protein  28.85 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0306  hypothetical protein  27.55 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3845  hypothetical protein  29.81 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.989826  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3663  hypothetical protein  30.77 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.281432  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3326  hypothetical protein  29 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00885978  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0573  hypothetical protein  25.47 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000392083  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0259  hypothetical protein  28.85 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000510441  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4160  hypothetical protein  28.85 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.951952  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3965  hypothetical protein  28.85 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.529125  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0152  hypothetical protein  30.28 
 
 
104 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000026617  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0136  hypothetical protein  30.28 
 
 
104 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0801  hypothetical protein  28.71 
 
 
113 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>