19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2170 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2170  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 		 138 aa  281  3.0000000000000004e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1161  excinuclease ATPase subunit  68.12 
 
 		 138 aa  206  6e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000979221  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0118  hypothetical protein  41.13 
 
 		 155 aa  112  3e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000449189  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2545  excinuclease ATPase subunit  44.93 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.378933  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1774  excinuclease ATPase subunit  42.34 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3872  excinuclease ATPase subunit  41.18 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.306665 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3700  putative excinuclease, ATPase subunit  36.69 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.351228 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4777  putative excinuclease, ATPase subunit  36.69 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.886024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0943  putative excinuclease, ATPase subunit  38.19 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0370143  normal  0.39067 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0706  putative excinuclease, ATPase subunit  39.44 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1162  hypothetical protein  36.23 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000143344  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3907  hypothetical protein  47.37 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.616252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1485  excinuclease ATPase-like protein  39.09 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0421  hypothetical protein  31.91 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244801  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3048  putative excinuclease, ATPase subunit  36.73 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0407127  normal  0.286707 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3614  excinuclease ATPase subunit  37.04 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4089  excinuclease ATPase subunit  37.04 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  0.916091 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0418  hypothetical protein  33.72 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.63884  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_003296  RS00762  putative signal peptide protein  25.74 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.44153  normal  0.410048 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>