17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06320 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_06320  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  410  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5573  hypothetical protein  45.59 
 
 
203 aa  171  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1525  hypothetical protein  31.48 
 
 
188 aa  105  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1115  hypothetical protein  34.57 
 
 
183 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167391  normal  0.930079 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2454  hypothetical protein  30.91 
 
 
767 aa  91.7  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0594275  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02159  hypothetical protein  26.83 
 
 
280 aa  82.4  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3388  hypothetical protein  33.06 
 
 
756 aa  80.5  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6186  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3643  hypothetical protein  37.29 
 
 
196 aa  74.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2021  hypothetical protein  36.28 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1944  hypothetical protein  36.28 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1361  hypothetical protein  31.03 
 
 
320 aa  57.4  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5242  hypothetical protein  27.05 
 
 
221 aa  51.6  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.577822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0767  hypothetical protein  27.27 
 
 
218 aa  48.9  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.635785  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1765  hypothetical protein  42.59 
 
 
240 aa  47.8  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.97626  normal  0.455491 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2224  hypothetical protein  27.87 
 
 
343 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.28777 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0261  hypothetical protein  24.31 
 
 
286 aa  42  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1805  hypothetical protein  30 
 
 
379 aa  41.6  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>