21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1000 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1000  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  269  9e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1798  hypothetical protein  42.55 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394364  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2309  hypothetical protein  33.61 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00812325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0148  hypothetical protein  47.69 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1556  hypothetical protein  33.04 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0947  hypothetical protein  26.67 
 
 
195 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4144  hypothetical protein  27.97 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0572  hypothetical protein  26.27 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541327  hitchhiker  0.00799235 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0488  hypothetical protein  28.81 
 
 
127 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2844  hypothetical protein  26.73 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00819039  normal  0.0885214 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3016  hypothetical protein  32.61 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.689478  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1070  hypothetical protein  32.05 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00610238  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0303  hypothetical protein  25.42 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0550  hypothetical protein  30.4 
 
 
128 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906026  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2912  hypothetical protein  30.4 
 
 
127 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0566  hypothetical protein  30.4 
 
 
127 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0733  hypothetical protein  30.4 
 
 
128 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1483  hypothetical protein  30.4 
 
 
128 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0105  hypothetical protein  30.4 
 
 
127 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516432  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0458  hypothetical protein  30.4 
 
 
135 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6143  hypothetical protein  27.12 
 
 
127 aa  40  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>