11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0303 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0303    100 
 
 		 369 bp  731    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.260436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0339  integrase catalytic subunit  86.76 
 
 		 1548 bp  63.9  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5143  integrase catalytic subunit  86.76 
 
 		 1539 bp  63.9  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.1652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1714  putative transposase  88.14 
 
 		 1542 bp  61.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2991  integrase catalytic subunit  88.14 
 
 		 1539 bp  61.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2672  integrase catalytic region  88.14 
 
 		 1539 bp  61.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4274    84.51 
 
 		 1540 bp  54  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6811    84 
 
 		 2852 bp  54  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4554    94.12 
 
 		 480 bp  52  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0536907 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0806  putative transposase IS3/IS911  96.43 
 
 		 1647 bp  48.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1742    93.75 
 
 		 1556 bp  48.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.812145 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>