More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2421 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2421  putative MxaR-like protein  100 
 
 
339 aa  679    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868605  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3047  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  77.29 
 
 
339 aa  546  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4033  ATPase  77.58 
 
 
339 aa  543  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3801  ATPase  76.99 
 
 
339 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3278  MoxR protein, putative  76.99 
 
 
339 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1525  moxR protein, putative  60.66 
 
 
342 aa  427  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0519563  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1895  ATPase  58.61 
 
 
338 aa  422  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0687  ATPase  57.96 
 
 
343 aa  409  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.139478  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1896  MoxR protein, putative  57.36 
 
 
340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.155762 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2040  ATPase  55.86 
 
 
339 aa  402  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0475  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.66 
 
 
345 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4146  ATPase  56.29 
 
 
343 aa  391  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.661035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4514  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.29 
 
 
343 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0165185  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0783  moxR protein  56.76 
 
 
339 aa  388  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.587731  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1911  ATPase  57.06 
 
 
356 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4628  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.99 
 
 
343 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8036  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.08 
 
 
343 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1825  ATPase  51.03 
 
 
339 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.953694 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4206  ATPase  55.39 
 
 
334 aa  363  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0979498  normal  0.146626 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2997  ATPase  51.05 
 
 
339 aa  356  2.9999999999999997e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0140199  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  33.54 
 
 
327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.65 
 
 
333 aa  160  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2749  ATPase  33.43 
 
 
385 aa  159  9e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3661  ATPase  33.73 
 
 
386 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199881  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  31.6 
 
 
309 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2453  ATPase  33.83 
 
 
390 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664644  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2498  ATPase  33.83 
 
 
390 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2490  ATPase  33.83 
 
 
390 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0433704  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.56 
 
 
319 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.58 
 
 
342 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2716  ATPase  34.25 
 
 
342 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0331951  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0715  ATPase  31.5 
 
 
334 aa  153  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1408  AAA family ATPase  34.25 
 
 
336 aa  153  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  decreased coverage  0.00669065 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0849  ATPase  36.12 
 
 
324 aa  152  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0895498  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  31.99 
 
 
319 aa  152  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  31.2 
 
 
325 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3028  ATPase  34.12 
 
 
318 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.34 
 
 
325 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  32.02 
 
 
328 aa  150  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  31.64 
 
 
323 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  33.63 
 
 
318 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1942  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.33 
 
 
322 aa  150  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0320  ATPase  31.72 
 
 
310 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  34.29 
 
 
331 aa  150  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  33.53 
 
 
335 aa  150  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1845  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35.08 
 
 
326 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2447  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.14 
 
 
331 aa  150  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2782  ATPase  33.53 
 
 
318 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  34.32 
 
 
353 aa  149  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.293908 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  33.97 
 
 
331 aa  149  5e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3577  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.74 
 
 
321 aa  149  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.274374  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  33.53 
 
 
318 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.53 
 
 
318 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.499216  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2762  ATPase  33.53 
 
 
318 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3090  MoxR domain-containing protein  32.84 
 
 
316 aa  149  7e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3184  ATPase  33.74 
 
 
318 aa  149  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11508  transcriptional regulatory protein moxR1  32.64 
 
 
377 aa  149  8e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269951  normal  0.0724803 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  31.69 
 
 
333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  30.91 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1406  ATPase  33.23 
 
 
318 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000750506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1471  ATPase  33.23 
 
 
318 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.928753  hitchhiker  0.00766173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1459  ATPase  33.23 
 
 
318 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938434  hitchhiker  0.000000501393 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2500  ATPase  36.07 
 
 
327 aa  147  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352977  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.14 
 
 
321 aa  147  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1627  ATPase  32.94 
 
 
318 aa  147  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296265 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  32.94 
 
 
325 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.15 
 
 
322 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  31.23 
 
 
327 aa  147  4.0000000000000006e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2427  ATPase  32.64 
 
 
318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.02 
 
 
354 aa  146  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1736  ATPase  35.41 
 
 
322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.757326 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1205  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35.33 
 
 
343 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2298  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.35 
 
 
360 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0063756  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0600  ATPase  27.83 
 
 
309 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0120764  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000309  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  30.03 
 
 
327 aa  145  8.000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.93 
 
 
341 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.23 
 
 
356 aa  145  9e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1323  ATPase  29.55 
 
 
309 aa  145  9e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.305812  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.45 
 
 
314 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0095  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.43 
 
 
342 aa  145  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3058  ATPase  32.44 
 
 
324 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2135  MoxR-like ATPase, putative transcriptional regulator, C1 metabolism  32.23 
 
 
319 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783557  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  34.58 
 
 
318 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2912  ATPase  34.38 
 
 
318 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  29.63 
 
 
320 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  33.9 
 
 
318 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3818  ATPase  34.28 
 
 
334 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  33.03 
 
 
347 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2964  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.92 
 
 
305 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460178 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5228  ATPase  33.03 
 
 
329 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0494  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.53 
 
 
313 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3201  ATPase  32.43 
 
 
319 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4860  ATPase  33.03 
 
 
329 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1586  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.94 
 
 
332 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.766852 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  35.58 
 
 
339 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1215  ATPase  31.01 
 
 
340 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4949  ATPase  33.03 
 
 
329 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  30.67 
 
 
340 aa  144  2e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  29.09 
 
 
326 aa  144  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  33.74 
 
 
331 aa  143  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>