36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2416 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2416  putative MxaL-like protein  100 
 
 
317 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345255  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3806  putative MxaL-like protein  62.33 
 
 
320 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4028  putative MxaL-like protein  54.3 
 
 
316 aa  287  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17942  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3052  MxaL protein, putative  54.87 
 
 
332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3273  MxaL protein, putative  54.91 
 
 
309 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0788  MxaL protein, putative  38.87 
 
 
323 aa  175  9e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.169917  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1530  MxaL protein, putative  37.59 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.766517  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1891  MxaL protein, putative  37.59 
 
 
353 aa  159  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0479077 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0480  von Willebrand factor type A  35.12 
 
 
342 aa  158  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1916  von Willebrand factor, type A  37.3 
 
 
322 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2035  MxaL protein, putative  33.21 
 
 
342 aa  149  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4141  von Willebrand factor type A  34.94 
 
 
335 aa  143  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4509  von Willebrand factor type A  34.14 
 
 
331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.720482 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4623  von Willebrand factor type A  34.55 
 
 
336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.22995  normal  0.878919 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0692  von Willebrand factor, type A  31.4 
 
 
324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1900  von Willebrand factor, type A  29.08 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.523701 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4201  von Willebrand factor type A  35.74 
 
 
351 aa  133  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.564539  normal  0.475934 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8031  von Willebrand factor type A  35.06 
 
 
334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1820  hypothetical protein  36.32 
 
 
364 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3002  von Willebrand factor, type A  37.02 
 
 
267 aa  119  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0120219  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  27.45 
 
 
335 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  27.45 
 
 
335 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  27.45 
 
 
335 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  28.25 
 
 
335 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  27.68 
 
 
335 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3038  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 
319 aa  50.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4480  von Willebrand factor, type A  28.06 
 
 
353 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11510  hypothetical protein  27.71 
 
 
335 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.311165 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  24.76 
 
 
327 aa  47  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1646  von Willebrand factor, type A  30.77 
 
 
354 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  26.87 
 
 
377 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  27.84 
 
 
349 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  27.87 
 
 
343 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  29.61 
 
 
344 aa  43.1  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  29.61 
 
 
344 aa  43.1  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  29.35 
 
 
334 aa  42.4  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>