14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1608 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1608  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  306  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292342  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1775  hypothetical protein  37.93 
 
 
396 aa  98.2  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.062181 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6097  hypothetical protein  36.42 
 
 
427 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901911  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0166  hypothetical protein  30.46 
 
 
436 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.539616 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4053  hypothetical protein  32.05 
 
 
407 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.838771  normal  0.549592 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1107  hypothetical protein  29.86 
 
 
318 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0283208  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4707  hypothetical protein  31.03 
 
 
289 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4335  hypothetical protein  28.1 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525857  normal  0.453219 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0990  hypothetical protein  29.17 
 
 
293 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.677101  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2561  hypothetical protein  29.93 
 
 
296 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3190  hypothetical protein  28.47 
 
 
146 aa  50.4  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3853  hypothetical protein  26.57 
 
 
302 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351938  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5645  hypothetical protein  29.09 
 
 
312 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0159  hypothetical protein  29 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>