19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4746 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4746  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  323  8.000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269368  normal  0.268137 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1033  hypothetical protein  54.49 
 
 
164 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2628  hypothetical protein  55.77 
 
 
155 aa  181  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1266  hypothetical protein  54.49 
 
 
155 aa  176  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3770  hypothetical protein  53.21 
 
 
155 aa  175  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1065  hypothetical protein  57.89 
 
 
157 aa  167  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5591  Domain of unknown function DUF1863  45.21 
 
 
165 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0444  hypothetical protein  33.07 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0362  Domain of unknown function DUF1863  27.91 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0544465  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4383  hypothetical protein  26.47 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2456  nuclease  30.77 
 
 
140 aa  44.7  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  33.73 
 
 
137 aa  44.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0027  hypothetical protein  26.27 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.177255 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1252  hypothetical protein  30.26 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.278967  normal  0.262068 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1165  hypothetical protein  32.08 
 
 
171 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.943911  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3995  hypothetical protein  30.77 
 
 
158 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3297  hypothetical protein  24.81 
 
 
291 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0054  nuclease  27.34 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00373612  normal 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4174  Domain of unknown function DUF1863  31.52 
 
 
202 aa  40.8  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.141515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>