23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5791 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 150 aa  310  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5798  cupin 2 domain-containing protein  86.67 
 
 		 150 aa  273  6e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0625  cupin 2 domain-containing protein  39.01 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815435 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4635  cupin 2, barrel  34.31 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3728  cupin 2 domain-containing protein  34.31 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0858246 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3793  cupin 2 domain-containing protein  34.31 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.742443  normal  0.0537176 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2367  hypothetical protein  34.07 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3610  cupin 2 domain-containing protein  32.85 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1216  cupin 2 domain-containing protein  36.11 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.365458  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0505  hypothetical protein  42.86 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.91 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0171538  hitchhiker  0.000000529343 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1401  hypothetical protein  42.86 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5282  hypothetical protein  37.93 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.274603 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0701  cupin 2 domain-containing protein  31.62 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.608661 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2942  hypothetical protein  31.62 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1567  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.88 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800776  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1841  cupin 2, barrel  30.71 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0498378 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2754  cupin 2 domain-containing protein  28.99 
 
 		 141 aa  70.1  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.71 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4216  cupin 2 domain-containing protein  33.08 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.014913 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0939  hypothetical protein  36.36 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  40.38 
 
 		 150 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>