17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5055 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5055  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  347  5e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0581426 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1421  hypothetical protein  53.42 
 
 		 161 aa  151  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  30.65 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  31.46 
 
 		 225 aa  49.7  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  31.46 
 
 		 225 aa  49.7  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  30.66 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  30.67 
 
 		 220 aa  47  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0625  Phage-related lysozyme (muraminidase)-like  33.64 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  34 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  34 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  30.65 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  29.93 
 
 		 149 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  29.93 
 
 		 149 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2493  glycoside hydrolase family 24  30.16 
 
 		 166 aa  42  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  28.81 
 
 		 150 aa  41.2  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  27.88 
 
 		 205 aa  40.8  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1733  glycoside hydrolase family 24  35.24 
 
 		 391 aa  40.4  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.614452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>