16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2163 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2163  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2101  hypothetical protein  86.47 
 
 
180 aa  307  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212882  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2502  hypothetical protein  66.26 
 
 
173 aa  216  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.88856 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3907  hypothetical protein  66.46 
 
 
173 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.801532 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5085  hypothetical protein  65.43 
 
 
177 aa  214  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.6936 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5349  hypothetical protein  64.42 
 
 
180 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.570428  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3613  hypothetical protein  65.19 
 
 
173 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3519  hypothetical protein  64.42 
 
 
183 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0333839 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0321  hypothetical protein  67.53 
 
 
175 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0426683  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2216  hypothetical protein  41.32 
 
 
170 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.931621  normal  0.927101 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1825  hypothetical protein  41.38 
 
 
172 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.668279  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4186  hypothetical protein  41.98 
 
 
170 aa  120  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.210187 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3899  hypothetical protein  38.95 
 
 
188 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0745  hypothetical protein  41.72 
 
 
183 aa  98.6  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.401797 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3810  hypothetical protein  35.88 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.622372  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3809  hypothetical protein  25.51 
 
 
150 aa  41.6  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>