31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0133 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0133  hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  712    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0418  hypothetical protein  64.72 
 
 
330 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4277  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  43.68 
 
 
346 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141779 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0424  hypothetical protein  29.28 
 
 
344 aa  89.7  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.938992  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0139  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III  29.35 
 
 
340 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3808  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  30.64 
 
 
339 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4271  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  26.13 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  hitchhiker  0.000248822 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3801  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  31.41 
 
 
351 aa  70.1  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7424  hypothetical protein  31.51 
 
 
363 aa  57  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0373604  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4278  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  26.8 
 
 
309 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.533396  hitchhiker  0.00544084 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6137  hypothetical protein  30.14 
 
 
363 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295579  normal  0.0515826 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3802  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  27.78 
 
 
316 aa  49.3  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2889  hypothetical protein  33.08 
 
 
346 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0540  hypothetical protein  33.08 
 
 
346 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1461  hypothetical protein  33.08 
 
 
346 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0127  hypothetical protein  33.08 
 
 
346 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0706  hypothetical protein  33.08 
 
 
346 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3157  hypothetical protein  33.08 
 
 
346 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3809  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  32.35 
 
 
326 aa  47.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0522  hypothetical protein  32.31 
 
 
346 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.724316  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6506  hypothetical protein  30.59 
 
 
364 aa  46.2  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3160  hypothetical protein  34.25 
 
 
332 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2886  hypothetical protein  34.25 
 
 
332 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0543  hypothetical protein  34.25 
 
 
332 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0525  hypothetical protein  34.25 
 
 
332 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1458  hypothetical protein  34.25 
 
 
332 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0130  hypothetical protein  34.25 
 
 
332 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6015  hypothetical protein  30.59 
 
 
364 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00375312  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5650  hypothetical protein  30.59 
 
 
364 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16977  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0710  hypothetical protein  34.25 
 
 
332 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.168981  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3414  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  25.97 
 
 
322 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175733 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>