40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7776 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7776  NifZ family protein  100 
 
 
122 aa  251  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357027  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7745  NifZ family protein  96.33 
 
 
140 aa  220  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1450  hypothetical protein  64.96 
 
 
126 aa  156  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487856 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1409  NifZ family protein  62.86 
 
 
111 aa  144  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1579  NifZ family protein  59.83 
 
 
120 aa  140  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.654864 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0116  NifZ family protein  54.32 
 
 
108 aa  97.8  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.780369 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0209  nifZ protein  48.39 
 
 
106 aa  97.1  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00067923  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5899  nitrogen fixation protein NifZ  50.62 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0192741  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4468  NifZ  50.59 
 
 
101 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1803  NifZ family protein  47.83 
 
 
104 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.250711  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1775  NifZ family protein  47.83 
 
 
104 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1068  NifZ  49.41 
 
 
99 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4009  NifZ family protein  52.38 
 
 
101 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5106  NifZ family protein  49.41 
 
 
99 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3599  NifZ family protein  53.01 
 
 
107 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.0277572 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0964  NifZ  48.24 
 
 
99 aa  88.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338549  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1243  NifZ family protein  48.24 
 
 
94 aa  87.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.753327 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3641  NifZ family protein  48.15 
 
 
101 aa  87.8  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2195  NifZ family protein  48.24 
 
 
94 aa  87.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.458852  normal  0.730387 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0544  nitrogen fixation protein NifZ  48.24 
 
 
94 aa  87.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.563723  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3957  NifZ  52.56 
 
 
95 aa  86.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000304465  hitchhiker  0.00212617 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1371  NifZ family protein  50 
 
 
95 aa  85.9  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4243  NifZ  51.25 
 
 
88 aa  85.5  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1573  NifZ family protein  51.9 
 
 
92 aa  85.5  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2368  NifZ family protein  51.28 
 
 
88 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0401  NifZ family protein  45.68 
 
 
111 aa  84  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1251  NifZ family protein  41.67 
 
 
100 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.275395  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1535  NifZ domain protein  41.67 
 
 
97 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0997  NifZ  50.67 
 
 
97 aa  82  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.334499  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2128  NifZ family protein  46.43 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4129  NifZ  40.51 
 
 
90 aa  76.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0507  NifZ family protein  48.65 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0277  NifZ family protein  51.43 
 
 
321 aa  67  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0714464  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1189  NifZ family protein  43.21 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000688158 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01680  nitrogen fixation protein NifZ  38 
 
 
159 aa  61.6  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1394  NifZ  41.1 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0463497  normal  0.159008 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0947  NifZ family protein  42.86 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0285448  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4479  NifZ  36.99 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.248929  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6872  NifZ family protein  36.62 
 
 
116 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1069  hypothetical protein  29.33 
 
 
85 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>