41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1577 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1577  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  274  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4599  membrane protein  73.64 
 
 
130 aa  154  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  0.568501 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2775  hypothetical protein  76.85 
 
 
178 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1375  membrane protein  76.6 
 
 
130 aa  144  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.743719 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1432  membrane protein  76.04 
 
 
130 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399467  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0972  membrane protein  76.04 
 
 
130 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0269392  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1454  membrane protein  76.04 
 
 
130 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1335  membrane protein-like protein  75.53 
 
 
129 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1352  hypothetical protein  77.78 
 
 
155 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.433588  normal  0.260577 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1861  membrane protein-like protein  73.96 
 
 
136 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159101 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1473  hypothetical protein  73.03 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0408  hypothetical protein  73.03 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1705  hypothetical protein  73.03 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0754  hypothetical protein  73.03 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2620  hypothetical protein  73.03 
 
 
146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0940  hypothetical protein  73.03 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1683  hypothetical protein  71.91 
 
 
149 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1557  hypothetical protein  57.8 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0981  membrane protein-like protein  54.37 
 
 
130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1666  hypothetical protein  58.1 
 
 
130 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.361842  hitchhiker  0.00498054 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1996  putative transmembrane protein  57.14 
 
 
130 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1129  hypothetical protein  54.29 
 
 
146 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00728064  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0866  membrane protein-like protein  52.58 
 
 
127 aa  101  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.060146  normal  0.425014 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3070  transmembrane protein  46.36 
 
 
122 aa  95.9  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  hitchhiker  0.000683085 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1980  hypothetical protein  53.19 
 
 
115 aa  94  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820316  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1248  transmembrane protein  57.28 
 
 
137 aa  92  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.948754  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2778  hypothetical protein  54.74 
 
 
115 aa  90.9  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2770  membrane protein-like protein  45.3 
 
 
130 aa  84.7  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0344559 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1829  membrane protein-like  47.17 
 
 
134 aa  80.1  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1669  membrane protein-like protein  42.11 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4967  membrane protein-like protein  48.96 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2990  membrane protein-like  47.31 
 
 
111 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1199  membrane protein-like protein  56.52 
 
 
138 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.553066  normal  0.423646 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1118  membrane protein-like protein  56.52 
 
 
138 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1518  putative transmembrane protein  48.96 
 
 
124 aa  72  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1453  membrane protein-like  44.55 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1421  putative transmembrane protein  47.83 
 
 
129 aa  58.9  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00663896 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3783  membrane protein-like protein  44.83 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0706  putative transmembrane protein  32.41 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.445384  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1072  hypothetical protein  32.32 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105151  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0519  putative transmembrane protein  39.68 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.978517 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>