49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1083 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1083  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  100 
 
 		 218 aa  431  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.316568 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2177  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  49.74 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2080  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  48.33 
 
 		 284 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0898874  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5764  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  51.46 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.733693  normal  0.933198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6008  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  51.46 
 
 		 284 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1540  ProP effector  50.29 
 
 		 183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1453  ProP effector  49.14 
 
 		 179 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0041  ProQ protein  49.14 
 
 		 200 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1323  ProP effector  45.14 
 
 		 171 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.929512  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5820  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  49.12 
 
 		 223 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.231664  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6185  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  49.12 
 
 		 223 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.942163  normal  0.876638 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6155  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  44.8 
 
 		 398 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.168417  normal  0.179511 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1492  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  46.29 
 
 		 222 aa  142  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7730  ProQ, activator of osmoprotectant transporter ProP  50.31 
 
 		 220 aa  141  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2615  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  59.29 
 
 		 178 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6664  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  49.38 
 
 		 224 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2621  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  39.34 
 
 		 180 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176786  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3083  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  40.72 
 
 		 169 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2182  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  39.08 
 
 		 171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3555  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  39.08 
 
 		 173 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.586954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1789  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  40.7 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30710  putative activator of osmoprotectant transporter  35.93 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00174135  hitchhiker  0.0000189108 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2401  putative solute/DNA competence effector  34.44 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1811  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  34.07 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.179036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2060  putative solute/DNA competence effector  34.07 
 
 		 232 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000898248  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1985  putative solute/DNA competence effector  33.33 
 
 		 228 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000228326  hitchhiker  0.0069158 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2564  putative solute/DNA competence effector  34.07 
 
 		 232 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000584376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01790  hypothetical protein  34.07 
 
 		 232 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1356  putative solute/DNA competence effector  34.07 
 
 		 232 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120043  normal  0.2491 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1922  putative solute/DNA competence effector  34.07 
 
 		 232 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.31825e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1801  putative solute/DNA competence effector  34.07 
 
 		 232 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.304179  normal  0.0872497 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01802  putative solute/DNA competence effector  34.07 
 
 		 232 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1469  putative solute/DNA competence effector  33.33 
 
 		 228 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00111252  normal  0.239206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1285  putative solute/DNA competence effector  33.33 
 
 		 228 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000538186  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1989  putative solute/DNA competence effector  33.33 
 
 		 228 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00261686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2047  putative solute/DNA competence effector  33.33 
 
 		 228 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.24524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2664  putative solute/DNA competence effector  33.7 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000764643  normal  0.0215757 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1671  putative solute/DNA competence effector  33.7 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000024891  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2118  putative solute/DNA competence effector  34.83 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00110468  hitchhiker  0.0000659128 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1782  putative solute/DNA competence effector  33.7 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0742372  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2099  putative solute/DNA competence effector  32.97 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000516503  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3447  hypothetical protein  35.78 
 
 		 279 aa  50.1  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1844  putative solute/DNA competence effector  32.22 
 
 		 243 aa  48.5  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.790888  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4697  ProQ family protein  35.29 
 
 		 114 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1663  hypothetical protein  30.3 
 
 		 121 aa  45.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1657  hypothetical protein  30.3 
 
 		 123 aa  45.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2188  putative solute/DNA competence effector  31.11 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.345813  normal  0.724108 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1721  putative solute/DNA competence effector  32.5 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000511987  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02001  putative solute/DNA competence effector  40.74 
 
 		 222 aa  42  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>