20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_19110 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_19110  Protein of unknown function (DUF2550)  100 
 
 		 146 aa  283  5e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314217  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3627  hypothetical protein  39.55 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4009  hypothetical protein  38.81 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632283 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2603  hypothetical protein  30.5 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00061892  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1309  hypothetical protein  32.84 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2336  hypothetical protein  29.79 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294111 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1765  hypothetical protein  34.78 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2405  putative secreted/membrane protein  39.26 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1838  hypothetical protein  39.39 
 
 		 146 aa  52  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2446  hypothetical protein  33.03 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.148013  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3914  hypothetical protein  38.84 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.693365  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6134  hypothetical protein  30.43 
 
 		 144 aa  51.2  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10050  Protein of unknown function (DUF2550)  37.72 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0338  Protein of unknown function DUF2550  37.07 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1074  Protein of unknown function DUF2550  33.33 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0902  hypothetical protein  29.75 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4133  Protein of unknown function DUF2550  35.87 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.857839  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1272  hypothetical protein  31.78 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.704856  normal  0.492421 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0655  hypothetical protein  30.65 
 
 		 181 aa  45.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.691478 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29530  Protein of unknown function (DUF2550)  32.76 
 
 		 144 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320914  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>