24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2367 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2367  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  299  7.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577514  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3610  cupin 2 domain-containing protein  96.53 
 
 
144 aa  290  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4635  cupin 2, barrel  95.14 
 
 
144 aa  286  6e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3728  cupin 2 domain-containing protein  95.14 
 
 
144 aa  286  6e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0858246 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3793  cupin 2 domain-containing protein  95.14 
 
 
144 aa  286  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.742443  normal  0.0537176 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  80.56 
 
 
144 aa  248  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800776  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2942  hypothetical protein  82.73 
 
 
144 aa  247  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1841  cupin 2, barrel  76.6 
 
 
141 aa  229  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0498378 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1567  hypothetical protein  74.82 
 
 
140 aa  227  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251308  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0701  cupin 2 domain-containing protein  77.86 
 
 
141 aa  224  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.608661 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  76.98 
 
 
140 aa  223  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4216  cupin 2 domain-containing protein  77.44 
 
 
138 aa  223  9e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.014913 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2754  cupin 2 domain-containing protein  76.26 
 
 
141 aa  217  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0625  cupin 2 domain-containing protein  68.89 
 
 
151 aa  193  6e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815435 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1216  cupin 2 domain-containing protein  70.15 
 
 
145 aa  191  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.365458  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5282  hypothetical protein  41.46 
 
 
191 aa  97.1  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.274603 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.6 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0171538  hitchhiker  0.000000529343 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0505  hypothetical protein  38.4 
 
 
133 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100148  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5798  cupin 2 domain-containing protein  36.3 
 
 
150 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.07 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1401  hypothetical protein  38.28 
 
 
133 aa  73.6  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0939  hypothetical protein  33.33 
 
 
266 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.67 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3217  cupin 2 domain-containing protein  35.87 
 
 
141 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349466  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>