48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1166 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1166  major facilitator transporter  100 
 
 
433 aa  852    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0795841  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.4 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.4 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6127  major facilitator transporter  25 
 
 
435 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  23.72 
 
 
418 aa  66.6  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  22.4 
 
 
427 aa  63.5  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 
414 aa  59.3  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0293  major facilitator transporter  23.46 
 
 
413 aa  56.6  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  23.99 
 
 
408 aa  53.1  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  23.99 
 
 
408 aa  53.1  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3471  major facilitator transporter  23.85 
 
 
419 aa  53.1  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  24.06 
 
 
408 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  21.3 
 
 
432 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0786  major facilitator transporter  24.73 
 
 
403 aa  51.2  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.104451  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  24.09 
 
 
408 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2100  major facilitator transporter  26.28 
 
 
408 aa  50.4  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  23.29 
 
 
408 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  24.09 
 
 
408 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  21.98 
 
 
444 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 
446 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  24.82 
 
 
397 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  23 
 
 
413 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  24.56 
 
 
446 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  23 
 
 
413 aa  48.5  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  24.93 
 
 
426 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  23.7 
 
 
453 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0127  macrolide-efflux protein  25.6 
 
 
412 aa  47.8  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  21.77 
 
 
412 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  23.04 
 
 
424 aa  46.6  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  23.41 
 
 
446 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 
405 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0240  transporter, putative  21.87 
 
 
393 aa  46.2  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0110  multidrug ABC transporter permease  26.36 
 
 
416 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  24.72 
 
 
406 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  21.07 
 
 
433 aa  45.8  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  22.09 
 
 
406 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  24.39 
 
 
435 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  23.48 
 
 
420 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  26.05 
 
 
413 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1603  putative permease  23.92 
 
 
421 aa  44.7  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  23.58 
 
 
405 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  23.58 
 
 
405 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2486  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 
415 aa  44.7  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.364713  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  25 
 
 
403 aa  44.3  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  23.99 
 
 
404 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  18.94 
 
 
412 aa  43.5  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  23.14 
 
 
408 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  22.69 
 
 
406 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>