29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1055 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1055  membrane protein-like  100 
 
 
773 aa  1505    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00532774  normal  0.601759 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5579  fusaric acid resistance protein region  89.43 
 
 
688 aa  602  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.152208  hitchhiker  0.00845324 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4721  fusaric acid resistance protein region  89.43 
 
 
688 aa  602  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00201941 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3646  fusaric acid resistance protein region  89.43 
 
 
688 aa  602  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0600324  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4113  fusaric acid resistance protein region  86.98 
 
 
679 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981168  normal  0.0322615 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4578  fusaric acid resistance protein region  84.73 
 
 
699 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.108784  hitchhiker  0.00000435415 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3974  fusaric acid resistance protein region  73.99 
 
 
720 aa  558  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0215831 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4353  fusaric acid resistance protein region  60.06 
 
 
665 aa  382  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4511  fusaric acid resistance protein  59.94 
 
 
663 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2192  Fusaric acid resistance protein conserved region  57.04 
 
 
671 aa  331  3e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2120  membrane protein, putative efflux pump  56.51 
 
 
680 aa  295  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0194  fusaric acid resistance protein region  50.64 
 
 
660 aa  289  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.140662  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0534  fusaric acid resistance domain-containing protein  43.85 
 
 
633 aa  251  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0595  fusaric acid resistance protein region  43.85 
 
 
633 aa  251  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0240  putative multidrug resistance protein MdtO  41.57 
 
 
600 aa  189  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6555  multidrug efflux system protein MdtO  43.55 
 
 
708 aa  150  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4638  multidrug efflux system protein MdtO  36.27 
 
 
683 aa  135  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3911  Fusaric acid resistance protein conserved region  36.27 
 
 
683 aa  135  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4326  multidrug efflux system protein MdtO  33.47 
 
 
683 aa  135  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3946  multidrug efflux system protein MdtO  36.27 
 
 
683 aa  134  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5589  multidrug efflux system protein MdtO  30.33 
 
 
683 aa  134  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03953  predicted multidrug efflux system component  36.27 
 
 
683 aa  134  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03913  hypothetical protein  36.27 
 
 
683 aa  134  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4545  multidrug efflux system protein MdtO  35.64 
 
 
683 aa  134  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  24.56 
 
 
395 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  26.98 
 
 
360 aa  47.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.52 
 
 
697 aa  46.2  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  30.17 
 
 
698 aa  44.7  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2694  hypothetical protein  29.93 
 
 
721 aa  44.3  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>