32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0961 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0961  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 134 aa  273  6e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6227  transcriptional regulator, HxlR family  73.53 
 
 		 107 aa  150  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56146  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2404  HxlR family transcriptional regulator  52.34 
 
 		 113 aa  106  9.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.598252  normal  0.595258 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3596  putative transcriptional regulator  52.38 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0219854  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5094  HxlR family transcriptional regulator  51.96 
 
 		 115 aa  97.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.709504  normal  0.631599 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1054  HxlR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1290  transcriptional regulator, HxlR family  43.1 
 
 		 134 aa  90.5  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1763  helix-turn-helix, HxlR type  42.72 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.168632  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3220  putative transcriptional regulator  45.98 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00911883  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1315  HxlR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.9488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7489  transcriptional regulator, HxlR family  46.51 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1972  putative transcriptional regulator  40.59 
 
 		 103 aa  62  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000001755  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2054  putative transcriptional regulator  38.3 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.295818  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3120  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0075021  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1528  putative transcriptional regulator  44.16 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1715  transcriptional regulator protein-like protein  39.13 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118442  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5059  putative transcriptional regulator  38.3 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306977 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1388  putative transcriptional regulator  37.63 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.682529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3145  putative transcriptional regulator  36.17 
 
 		 101 aa  57  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2492  putative transcriptional regulator  36.17 
 
 		 101 aa  57  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298845  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0609  transcriptional regulator, HxlR family  39.56 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.822325  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1397  transcriptional regulator, HxlR family  30.69 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1090  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000252079  normal  0.0375915 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3139  transcriptional regulator, HxlR family  31.97 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  34.74 
 
 		 236 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2326  HxlR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 237 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.503495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  30.36 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  30.11 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  29.81 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3098  MarR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2323  hypothetical protein  28.85 
 
 		 127 aa  40  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0166968  normal  0.857189 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>