50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6665 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6665  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.742251  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6186  hypothetical protein  97.94 
 
 
194 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327018  normal  0.86985 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5821  hypothetical protein  97.94 
 
 
194 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7732  hypothetical protein  87.11 
 
 
194 aa  357  7e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6007  hypothetical protein  84.97 
 
 
194 aa  350  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.245957  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5762  hypothetical protein  84.38 
 
 
194 aa  345  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.443693  normal  0.551739 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6156  hypothetical protein  79.27 
 
 
194 aa  320  8e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159993  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6760  hypothetical protein  62.15 
 
 
196 aa  235  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3745  hypothetical protein  38.92 
 
 
190 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2721  hypothetical protein  34.3 
 
 
213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2081  hypothetical protein  31.82 
 
 
193 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0378  hypothetical protein  29.38 
 
 
180 aa  104  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0374  hypothetical protein  29.48 
 
 
182 aa  102  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1173  hypothetical protein  32.58 
 
 
187 aa  101  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.137716 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4883  hypothetical protein  31.58 
 
 
224 aa  99  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2539  hypothetical protein  34.5 
 
 
190 aa  98.6  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.421642 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1755  hypothetical protein  32.75 
 
 
186 aa  98.2  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0946403  normal  0.917743 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1967  hypothetical protein  32.75 
 
 
186 aa  98.2  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0333  hypothetical protein  31.91 
 
 
199 aa  97.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000989305  hitchhiker  0.00834718 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5536  hypothetical protein  29.38 
 
 
192 aa  97.1  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1574  hypothetical protein  29.94 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452376 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2436  hypothetical protein  35.06 
 
 
196 aa  92.8  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.774495  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3830  hypothetical protein  33.69 
 
 
194 aa  90.9  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219865  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0742  hypothetical protein  35.11 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0468  hypothetical protein  33.33 
 
 
253 aa  86.3  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0553  hypothetical protein  32 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0457  hypothetical protein  32.42 
 
 
208 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0473  hypothetical protein  31.87 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5657  hypothetical protein  45.26 
 
 
95 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5977  hypothetical protein  28.21 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2650  hypothetical protein  28.21 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2679  hypothetical protein  28.21 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806298  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0015  hypothetical protein  27.75 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2402  hypothetical protein  27.75 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2039  hypothetical protein  28.21 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0274  hypothetical protein  27.75 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2674  hypothetical protein  27.75 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2697  hypothetical protein  28.21 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2571  hypothetical protein  28.21 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0816  hypothetical protein  27.23 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.313298  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0529  hypothetical protein  28.96 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0170564  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0812  hypothetical protein  27.23 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0974  hypothetical protein  27.23 
 
 
252 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0645  hypothetical protein  26.18 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577978  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0652  hypothetical protein  26.29 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0518  hypothetical protein  28.73 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0673  hypothetical protein  25.91 
 
 
246 aa  72  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3293  hypothetical protein  26.94 
 
 
246 aa  72  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.430478  normal  0.990698 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0442  hypothetical protein  29.14 
 
 
245 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1421  hypothetical protein  31.94 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000974382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>