14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6376 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6376  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 68 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.465787 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5502  Flp/Fap pilin component  98.53 
 
 		 68 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253434  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6788  Flp/Fap pilin component  98.53 
 
 		 68 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.234531 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7205  Flp/Fap pilin component  79.41 
 
 		 68 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0699567  normal  0.486498 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6288  Flp/Fap pilin component  77.78 
 
 		 68 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0180675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5992  Flp/Fap pilin component  62.96 
 
 		 68 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.651462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0595  Flp/Fap pilin component  58 
 
 		 56 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.311439  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5991  Flp/Fap pilin component  36.67 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.848765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1736  Flp/Fap pilin component  35.38 
 
 		 69 aa  45.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000234566  hitchhiker  0.0000333634 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  35.59 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  35 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0788  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2021  Flp/Fap pilin component  40.82 
 
 		 67 aa  42  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0651  Flp/Fap pilin component  48.84 
 
 		 57 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>