18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6127 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6127  major facilitator transporter  100 
 
 		 435 aa  858    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1166  major facilitator transporter  25 
 
 		 433 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0795841  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  21.7 
 
 		 406 aa  53.9  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2064  major facilitator superfamily MFS_1  20.99 
 
 		 411 aa  50.4  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0419892  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 447 aa  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  23.13 
 
 		 440 aa  47.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  22.66 
 
 		 415 aa  47.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 425 aa  47  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  23.39 
 
 		 425 aa  47  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  23.65 
 
 		 446 aa  46.6  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0240  transporter, putative  21.46 
 
 		 393 aa  44.7  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  20.77 
 
 		 439 aa  44.3  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003101  diaminobutyrate-pyruvate transaminase/L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  24.55 
 
 		 958 aa  44.3  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2234  H+ antiporter protein  27.85 
 
 		 412 aa  44.3  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02741  hypothetical protein  24.55 
 
 		 963 aa  43.5  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  22.59 
 
 		 408 aa  43.5  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1226  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 		 423 aa  43.5  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.403066 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>