215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2064 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2064  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 411 aa  822    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0419892  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  22.46 
 
 		 1833 aa  90.5  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 423 aa  89  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 418 aa  87  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  21.98 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  22.89 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  21.74 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  21.64 
 
 		 415 aa  76.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  21.15 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  24.17 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  23.75 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  19.61 
 
 		 1816 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  25 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  22.34 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  21.57 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  22.34 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  22.34 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  23.7 
 
 		 432 aa  70.1  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 408 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  22.04 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  23.87 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  22.51 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  26.04 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  21.96 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2211  major facilitator transporter  22.63 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2250  major facilitator transporter  22.63 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  23.82 
 
 		 422 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  24.65 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  23.6 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  23.89 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  22.64 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  21.05 
 
 		 440 aa  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  23.06 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  24.24 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.1 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  24.24 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  23.46 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  18.72 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  18.72 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1864  major facilitator transporter  20.12 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  22.32 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  22.42 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  20.63 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2686  tetracycline resistance determinant TetV  23.38 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  22.69 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  22.69 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1780  transporter, putative  25.93 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  23.68 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  21.16 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  21.59 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  20.69 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  20.79 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  26.45 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  23.85 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  20.92 
 
 		 451 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  25.32 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  23.59 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  23.59 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3535  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 366 aa  57  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00357362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0805  major facilitator superfamily MFS_1  20 
 
 		 459 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  21.88 
 
 		 439 aa  55.8  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  18.22 
 
 		 1829 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  21.24 
 
 		 433 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19310  hypothetical protein  22.91 
 
 		 571 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  19.28 
 
 		 427 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  22.19 
 
 		 440 aa  55.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6127  major facilitator transporter  22.19 
 
 		 435 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  21.85 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  22.57 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1662  hypothetical protein  22.91 
 
 		 572 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0786  major facilitator transporter  20.21 
 
 		 403 aa  53.9  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.104451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  22.06 
 
 		 530 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  19.72 
 
 		 586 aa  53.9  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0062  putative membrane transport protein  19.71 
 
 		 418 aa  53.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2534  major facilitator superfamily MFS_1  22.12 
 
 		 410 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  19.67 
 
 		 406 aa  53.5  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  20.3 
 
 		 425 aa  53.5  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  20 
 
 		 425 aa  53.5  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  18.93 
 
 		 406 aa  53.5  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  21.65 
 
 		 423 aa  53.1  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  18.85 
 
 		 1806 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  19.67 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  20.48 
 
 		 429 aa  52.4  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  21.91 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  22.86 
 
 		 411 aa  52.4  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  22.13 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  26.07 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  19.55 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  21.19 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3741  major facilitator transporter  20.51 
 
 		 426 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  18.51 
 
 		 1839 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>