41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0972 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1454  membrane protein  100 
 
 		 130 aa  247  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0972  membrane protein  100 
 
 		 130 aa  247  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0269392  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1432  membrane protein  99.23 
 
 		 130 aa  247  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4599  membrane protein  91.54 
 
 		 130 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  0.568501 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1375  membrane protein  94.62 
 
 		 130 aa  207  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.743719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1335  membrane protein-like protein  95.92 
 
 		 129 aa  187  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1861  membrane protein-like protein  91.53 
 
 		 136 aa  166  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159101 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0940  hypothetical protein  83.33 
 
 		 149 aa  150  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1473  hypothetical protein  83.33 
 
 		 149 aa  150  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0408  hypothetical protein  83.33 
 
 		 149 aa  150  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1705  hypothetical protein  83.33 
 
 		 149 aa  150  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0754  hypothetical protein  83.33 
 
 		 149 aa  150  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2620  hypothetical protein  68.1 
 
 		 146 aa  151  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2775  hypothetical protein  78.12 
 
 		 178 aa  148  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1683  hypothetical protein  82.22 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1352  hypothetical protein  68.6 
 
 		 155 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.433588  normal  0.260577 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1557  hypothetical protein  59.02 
 
 		 129 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1577  hypothetical protein  76.04 
 
 		 141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1666  hypothetical protein  58.87 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.361842  hitchhiker  0.00498054 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1996  putative transmembrane protein  64.29 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0981  membrane protein-like protein  50 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1129  hypothetical protein  50 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00728064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1980  hypothetical protein  56.7 
 
 		 115 aa  103  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1248  transmembrane protein  55.36 
 
 		 137 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.948754  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3070  transmembrane protein  47.37 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  hitchhiker  0.000683085 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0866  membrane protein-like protein  50 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.060146  normal  0.425014 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1669  membrane protein-like protein  45.45 
 
 		 135 aa  87  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4967  membrane protein-like protein  47.96 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2778  hypothetical protein  48 
 
 		 115 aa  85.1  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1118  membrane protein-like protein  48.98 
 
 		 138 aa  84  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1199  membrane protein-like protein  48.98 
 
 		 138 aa  84  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.553066  normal  0.423646 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2990  membrane protein-like  45.92 
 
 		 111 aa  84  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1829  membrane protein-like  43.24 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2770  membrane protein-like protein  52.05 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0344559 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1518  putative transmembrane protein  45.92 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1453  membrane protein-like  49.52 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3783  membrane protein-like protein  51.19 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1421  putative transmembrane protein  46.74 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00663896 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0706  putative transmembrane protein  36.61 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.445384  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1072  hypothetical protein  31.82 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0519  putative transmembrane protein  42 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.978517 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>