17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3946 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3946  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.125264 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0126  hypothetical protein  43.09 
 
 
227 aa  107  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0086  hypothetical protein  36.84 
 
 
226 aa  86.7  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.393025  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4644  hypothetical protein  37.73 
 
 
229 aa  73.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8249  hypothetical protein  39.05 
 
 
253 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0455  hypothetical protein  29.96 
 
 
226 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184475  normal  0.579054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0897  hypothetical protein  27.83 
 
 
226 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870486  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2720  hypothetical protein  26.21 
 
 
229 aa  58.9  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.025893  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0597  hypothetical protein  28.4 
 
 
232 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4353  hypothetical protein  31.4 
 
 
232 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.442825  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6370  hypothetical protein  26.24 
 
 
248 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3896  hypothetical protein  27.97 
 
 
405 aa  45.4  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6172  hypothetical protein  27.38 
 
 
255 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5596  hypothetical protein  28.14 
 
 
439 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00840265  normal  0.0208396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3730  hypothetical protein  25.43 
 
 
366 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2023  hypothetical protein  30.51 
 
 
259 aa  45.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03190  hypothetical protein  32.19 
 
 
211 aa  43.5  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>