36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1621 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1621  protein of unknown function DUF1458  100 
 
 
68 aa  134  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.694094  normal  0.69633 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2262  protein of unknown function DUF1458  77.94 
 
 
68 aa  110  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0658  hypothetical protein  67.69 
 
 
67 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.870127  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3624  hypothetical protein  60 
 
 
67 aa  79.7  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178582  normal  0.0835288 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1669  hypothetical protein  60 
 
 
70 aa  79.7  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161634  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1437  hypothetical protein  51.56 
 
 
69 aa  70.5  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71589  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2258  hypothetical protein  50.77 
 
 
78 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.266107  normal  0.0441451 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3035  protein of unknown function DUF1458  42.42 
 
 
67 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.962791  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2364  protein of unknown function DUF1458  36.92 
 
 
71 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2854  hypothetical protein  35.38 
 
 
67 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4704  hypothetical protein  33.85 
 
 
67 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2417  hypothetical protein  36.76 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0138053 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0494  protein of unknown function DUF1458  36.76 
 
 
70 aa  47.8  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0732836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0202  protein of unknown function DUF1458  35.29 
 
 
70 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2636  protein of unknown function DUF1458  31.82 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1727  protein of unknown function DUF1458  40.91 
 
 
70 aa  47  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3381  protein of unknown function DUF1458  35.29 
 
 
69 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000254634  hitchhiker  0.000432895 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0965  hypothetical protein  33.85 
 
 
70 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3625  hypothetical protein  33.85 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.959697 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0035  protein of unknown function DUF1458  40.74 
 
 
71 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.150781  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2825  hypothetical protein  30.88 
 
 
68 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390532  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1441  hypothetical protein  40.62 
 
 
70 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.857436  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07040  hypothetical protein  35.48 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0507  hypothetical protein  30.88 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1416  protein of unknown function DUF1458  33.82 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.065081  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3459  TRIM7; tripartite subunit-containing 7  32.81 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1265  hypothetical protein  30.88 
 
 
70 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5942  hypothetical protein  36.76 
 
 
70 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0881826  hitchhiker  0.00766382 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2454  protein of unknown function DUF1458  33.82 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.803426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2570  hypothetical protein  30.88 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151944  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0118  hypothetical protein  26.47 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.813718  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1966  hypothetical protein  35.29 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.653562  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2850  protein of unknown function DUF1458  29.41 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0268  hypothetical protein  32.35 
 
 
69 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2249  hypothetical protein  37.88 
 
 
72 aa  40  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2274  protein of unknown function DUF1458  33.82 
 
 
70 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000872393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>