More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6473 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_07884  nonribosomal peptide synthase, putative (JCVI)  26.35 
 
 		 7214 aa  781    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.729291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2090  amino acid adenylation domain-containing protein  29.1 
 
 		 1568 aa  665    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  33.87 
 
 		 3208 aa  967    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0873  putative non-ribosomal peptide synthetase  34.54 
 
 		 3294 aa  1010    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  34.49 
 
 		 4468 aa  686    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1875  amino acid adenylation domain-containing protein  37.81 
 
 		 1990 aa  1243    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  34.04 
 
 		 2628 aa  1170    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1877  amino acid adenylation domain-containing protein  34.83 
 
 		 1525 aa  725    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  34.47 
 
 		 4317 aa  1214    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  35.37 
 
 		 5328 aa  1430    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  34.05 
 
 		 3235 aa  1060    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  34.58 
 
 		 5953 aa  695    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  33.25 
 
 		 6889 aa  703    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3701  non-ribosomal peptide synthase  35.52 
 
 		 3962 aa  1291    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  35.27 
 
 		 4336 aa  1273    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  33.17 
 
 		 2625 aa  1162    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  33.4 
 
 		 2151 aa  659    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  33.94 
 
 		 2875 aa  1235    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  35.63 
 
 		 6081 aa  687    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  32.2 
 
 		 5929 aa  638    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  33.18 
 
 		 8914 aa  643    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  35.61 
 
 		 6176 aa  1206    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  33.51 
 
 		 4531 aa  686    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  34.55 
 
 		 4317 aa  1219    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  35.71 
 
 		 8646 aa  717    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1715  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  27.34 
 
 		 2543 aa  1003    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1716  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  28.23 
 
 		 3044 aa  1102    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1717  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  28.82 
 
 		 2295 aa  926    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  37.83 
 
 		 5230 aa  1421    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  35.63 
 
 		 3328 aa  689    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  32.74 
 
 		 2883 aa  1065    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  29.93 
 
 		 3395 aa  1251    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  35.3 
 
 		 4336 aa  1258    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  32.97 
 
 		 2666 aa  1125    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  33.9 
 
 		 2154 aa  652    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  33.91 
 
 		 2883 aa  1232    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  34.93 
 
 		 3348 aa  692    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  32.9 
 
 		 5926 aa  649    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  33.03 
 
 		 9498 aa  691    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  33.08 
 
 		 5372 aa  689    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  34.61 
 
 		 3231 aa  1179    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  33.49 
 
 		 13537 aa  703    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  34.58 
 
 		 6676 aa  721    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1411  linear gramicidin synthetase subunit C  35.67 
 
 		 1719 aa  672    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.750656  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  32.89 
 
 		 3629 aa  1052    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  34.81 
 
 		 2156 aa  907    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  30.12 
 
 		 2138 aa  687    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2575  non-ribosomal peptide synthase  33.98 
 
 		 2979 aa  1091    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  31.85 
 
 		 3308 aa  695    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  33.02 
 
 		 3498 aa  1075    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  34.64 
 
 		 2033 aa  1120    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  35.56 
 
 		 6006 aa  692    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2086  putative siderophore related no-ribosomal peptide synthase  34.47 
 
 		 3287 aa  1013    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  33.97 
 
 		 3432 aa  1485    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2663  nonribosomal peptide synthetase  34.02 
 
 		 2979 aa  1095    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1874  amino acid adenylation domain-containing protein  33.47 
 
 		 1553 aa  707    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  34.3 
 
 		 6072 aa  690    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  34.3 
 
 		 4572 aa  689    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  34.94 
 
 		 3291 aa  694    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  36.06 
 
 		 5654 aa  1397    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  33.71 
 
 		 4502 aa  1421    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2569  amino acid adenylation domain-containing protein  33.52 
 
 		 2971 aa  882    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  35.77 
 
 		 5467 aa  1394    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  33.02 
 
 		 4968 aa  1338    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2093  amino acid adenylation domain-containing protein  29.97 
 
 		 2410 aa  691    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1859  amino acid adenylation domain-containing protein  35.18 
 
 		 2596 aa  1353    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  35.43 
 
 		 4332 aa  1309    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4786  non-ribosomal peptide synthase  35.34 
 
 		 3219 aa  1007    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  35.2 
 
 		 2370 aa  733    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  33 
 
 		 4037 aa  1300    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2092  amino acid adenylation domain-containing protein  37.27 
 
 		 1661 aa  961    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1956  non-ribosomal peptide synthetase, putative  34.38 
 
 		 2967 aa  1111    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  32.19 
 
 		 3650 aa  966    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2418  peptide synthetase-like protein  34.21 
 
 		 3296 aa  1015    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11449  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  34.13 
 
 		 4991 aa  1381    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  34.36 
 
 		 4489 aa  640    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2460  amino acid adenylation  33.72 
 
 		 2605 aa  692    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441641  normal  0.494441 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2461  amino acid adenylation  33.39 
 
 		 4606 aa  1107    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.782467 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  30.39 
 
 		 6404 aa  1275    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0525  non-ribosomal peptide synthase  34.33 
 
 		 3180 aa  1090    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1927  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaJ  34.54 
 
 		 3290 aa  1012    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2097  amino acid adenylation domain-containing protein  25.95 
 
 		 1992 aa  654    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164393  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1160  amino acid adenylation  35.49 
 
 		 3231 aa  1016    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1537  amino acid adenylation domain-containing protein  35.2 
 
 		 3227 aa  999    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  36.52 
 
 		 3176 aa  1019    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 		 3018 aa  6081    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0194792 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  36.58 
 
 		 4136 aa  1392    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1598  amino acid adenylation domain-containing protein  35.62 
 
 		 3219 aa  1016    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546873 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  35.8 
 
 		 4342 aa  1294    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  35.53 
 
 		 5149 aa  1434    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  35.83 
 
 		 4342 aa  1285    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  32.95 
 
 		 3291 aa  656    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1640  amino acid adenylation domain-containing protein  35.49 
 
 		 3231 aa  1016    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2522  non-ribosomal peptide synthase  34.02 
 
 		 2979 aa  1091    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207691  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1942  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaJ  34.47 
 
 		 3290 aa  1011    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  35.71 
 
 		 2651 aa  1130    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1625  putative non-ribosomal peptide synthetase  34.54 
 
 		 3297 aa  1010    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0842979  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2137  linear gramicidin synthetase subunit C  35.67 
 
 		 1719 aa  672    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  35.63 
 
 		 3352 aa  689    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0288  putative non-ribosomal peptide synthetase  34.54 
 
 		 3294 aa  1010    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>