19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3982 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3982  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.122943 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4446  hypothetical protein  97.83 
 
 		 230 aa  410  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.348408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5746  hypothetical protein  84.35 
 
 		 229 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0879668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3810  hypothetical protein  84.35 
 
 		 229 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3727  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4558  hypothetical protein  84.35 
 
 		 229 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.396699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1287  hypothetical protein  83.48 
 
 		 249 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0101  putative lipoprotein  70 
 
 		 230 aa  317  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319012  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0108  putative lipoprotein  70 
 
 		 230 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1589  hypothetical protein  69.57 
 
 		 230 aa  315  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0134  putative lipoprotein  69.57 
 
 		 230 aa  315  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4090  hypothetical protein  77.39 
 
 		 229 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.503896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6632  hypothetical protein  65.37 
 
 		 243 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2038  lipoprotein, putative  51.3 
 
 		 247 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000251498 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0512  hypothetical protein  40.36 
 
 		 239 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1103  hypothetical protein  42.31 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2794  hypothetical protein  40.22 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0085  hypothetical protein  37.27 
 
 		 546 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0370  hypothetical protein  40.57 
 
 		 525 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1860  hypothetical protein  40 
 
 		 546 aa  43.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>