19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4446 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4446  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  453  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.348408  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3982  hypothetical protein  97.83 
 
 
230 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.122943 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5746  hypothetical protein  83.04 
 
 
229 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0879668  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3810  hypothetical protein  83.04 
 
 
229 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3727  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4558  hypothetical protein  83.04 
 
 
229 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.396699  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1287  hypothetical protein  82.17 
 
 
249 aa  363  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180976  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0101  putative lipoprotein  70 
 
 
230 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319012  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0108  putative lipoprotein  70 
 
 
230 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1589  hypothetical protein  69.57 
 
 
230 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0134  putative lipoprotein  69.57 
 
 
230 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4090  hypothetical protein  76.96 
 
 
229 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.503896  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6632  hypothetical protein  66.67 
 
 
243 aa  266  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311637  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2038  lipoprotein, putative  50.87 
 
 
247 aa  206  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000251498 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0512  hypothetical protein  40.36 
 
 
239 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1103  hypothetical protein  42.86 
 
 
244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2794  hypothetical protein  40.22 
 
 
238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0085  hypothetical protein  36.42 
 
 
546 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0370  hypothetical protein  43.01 
 
 
525 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1860  hypothetical protein  40 
 
 
546 aa  43.5  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>