19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4558 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5746  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0879668  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3810  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3727  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4558  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.396699  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1287  hypothetical protein  84.72 
 
 
249 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180976  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3982  hypothetical protein  84.35 
 
 
230 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.122943 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4446  hypothetical protein  83.04 
 
 
230 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.348408  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0108  putative lipoprotein  71.3 
 
 
230 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0101  putative lipoprotein  70.87 
 
 
230 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319012  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1589  hypothetical protein  70.43 
 
 
230 aa  309  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0134  putative lipoprotein  70.43 
 
 
230 aa  309  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4090  hypothetical protein  74.67 
 
 
229 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.503896  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6632  hypothetical protein  62.77 
 
 
243 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311637  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2038  lipoprotein, putative  52.4 
 
 
247 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000251498 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0512  hypothetical protein  42.17 
 
 
239 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2794  hypothetical protein  39.6 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1103  hypothetical protein  41.53 
 
 
244 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0085  hypothetical protein  39.71 
 
 
546 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1860  hypothetical protein  39.01 
 
 
546 aa  45.4  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0370  hypothetical protein  38.68 
 
 
525 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>