23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5798 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5798  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 150 aa  310  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  86.67 
 
 		 150 aa  273  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3610  cupin 2 domain-containing protein  36.5 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0625  cupin 2 domain-containing protein  36.88 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815435 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2367  hypothetical protein  36.3 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4635  cupin 2, barrel  35.77 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3728  cupin 2 domain-containing protein  35.77 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0858246 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3793  cupin 2 domain-containing protein  35.77 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.742443  normal  0.0537176 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0701  cupin 2 domain-containing protein  36.03 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.608661 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2942  hypothetical protein  33.82 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1567  hypothetical protein  37.21 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1841  cupin 2, barrel  35.51 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0498378 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0505  hypothetical protein  45.22 
 
 		 133 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.02 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0171538  hitchhiker  0.000000529343 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.09 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800776  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1216  cupin 2 domain-containing protein  35.81 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.365458  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4216  cupin 2 domain-containing protein  37.21 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.014913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5282  hypothetical protein  36.57 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.274603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.04 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2754  cupin 2 domain-containing protein  32.61 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1401  hypothetical protein  39.5 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0939  hypothetical protein  35.45 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  31.82 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>