29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4578 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4578  fusaric acid resistance protein region  100 
 
 		 699 aa  1346    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.108784  hitchhiker  0.00000435415 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4353  fusaric acid resistance protein region  53.67 
 
 		 665 aa  665    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5579  fusaric acid resistance protein region  84.86 
 
 		 688 aa  1048    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.152208  hitchhiker  0.00845324 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3974  fusaric acid resistance protein region  81.49 
 
 		 720 aa  1049    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0215831 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4721  fusaric acid resistance protein region  84.86 
 
 		 688 aa  1048    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00201941 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4511  fusaric acid resistance protein  54.35 
 
 		 663 aa  660    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3646  fusaric acid resistance protein region  84.86 
 
 		 688 aa  1048    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0600324  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4113  fusaric acid resistance protein region  92.15 
 
 		 679 aa  1090    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981168  normal  0.0322615 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2192  Fusaric acid resistance protein conserved region  49.72 
 
 		 671 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1055  membrane protein-like  85.8 
 
 		 773 aa  568  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00532774  normal  0.601759 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2120  membrane protein, putative efflux pump  48.7 
 
 		 680 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0194  fusaric acid resistance protein region  45.06 
 
 		 660 aa  439  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.140662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0534  fusaric acid resistance domain-containing protein  37.48 
 
 		 633 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0595  fusaric acid resistance protein region  37.48 
 
 		 633 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0240  putative multidrug resistance protein MdtO  37.27 
 
 		 600 aa  328  3e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6555  multidrug efflux system protein MdtO  30.68 
 
 		 708 aa  187  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5589  multidrug efflux system protein MdtO  26.43 
 
 		 683 aa  147  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4326  multidrug efflux system protein MdtO  26.12 
 
 		 683 aa  144  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4638  multidrug efflux system protein MdtO  26.12 
 
 		 683 aa  144  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4545  multidrug efflux system protein MdtO  26.3 
 
 		 683 aa  144  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3911  Fusaric acid resistance protein conserved region  37.04 
 
 		 683 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3946  multidrug efflux system protein MdtO  37.04 
 
 		 683 aa  132  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03953  predicted multidrug efflux system component  37.04 
 
 		 683 aa  132  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03913  hypothetical protein  37.04 
 
 		 683 aa  132  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  25 
 
 		 395 aa  52.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  28.26 
 
 		 725 aa  46.6  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  26.11 
 
 		 359 aa  46.6  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  25 
 
 		 697 aa  46.6  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  26.95 
 
 		 360 aa  45.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>